Search is not available for this dataset
id
stringlengths 9
65
| sequence
stringlengths 28
512
| secondary_structure
stringlengths 28
512
| family
stringclasses 9
values |
|---|---|---|---|
16S_rRNA-A.fulgidus_domain1 | AUUCUGGUUGAUCCUGCCAGAGGCCGCUGCUAUCCGGCUGGGACUAAGCCAUGCGAGUCAAGGGGCUUGUAUCCCUUCGGGGAUGCAAGCACCGGCGGACGGCUCAGUAACACGUGGACAACCUGCCCUCGGGUGGGGGAUAACCCCGGGAAACUGGGGCUAAUCCCCCAUAGGGGAUGGGUACUGGAAUGUCCCAUCUCCGAAAGCGCUUAGCGCCCGAGGAUGGGUCUGCGGCGGAUUAGGUUGUUGGUGGGGUAACGGCCCACCAAGCCGAAGAUCCGUACGGGCCAUGAGAGUGGGAGCCCGGAGAUGGACCCUGAGACACGGGUCCAGGCCCUACGGGGCGCAGCAGGCGCGAAACCUCCGCAAUGCGGGAAACCGCGACGGGGUCAGCCGGAGUGCUCGCGCAUCGCGCGGGCUGUCGGGGUGCCUAAAAAGCACCCCACAGCAAGGGCCGGGCAAGGCCGGUGGCAGCCGCCGCGGUAAUACCGGCGGCCCGAGUGGCGGCCACU | ...(((((.......))))).((((((((((.((((((((((.....(((.(((..(((..((.(((((((((((....))))))))))).)))))......(((.......(((((((..((...(((((((.((((.....((((((....))))))......))))....((((((((.((......)))))))))).....((.....)).)))))))..))))))))).(((....(((..((((((((.......)))))))))))......)))..((((((((....))))...))))))).((((((..........)))))).((((....))))...)))))).).....(.(((...(((((....))))).)))).)))))))))..((((((((...))))))))....(((((((.......))))))).......(((((((((....((((.....((.))))).......)))))))))).))))))))))... | 16S_rRNA |
16S_rRNA-A.fulgidus_domain2 | UUUAUUGGGCCUAAAGCGUCCGUAGCCGGGCUGGUAAGUCCUCCGGGAAAUCUGGCGGCUUAACCGUCAGACUGCCGGAGGAUACUGCCAGCCUAGGGACCGGGAGAGGCCGGGGGUAUUCCCGGAGUAGGGGUGAAAUCCUGUAAUCCCGGGAGGACCACCUGUGGCGAAGGCGCCCGGCUGGAACGGGUCCGACGGUGAGGGACGAAGGCCAGGGGAGCGAACCGGAUUAGAUACCCGGGUAGUCCUGGCUGUAAACGAUGCGGACUAGGUGUCACCGAAGCUACGAGCUUCGGUGGUGCCGGAGGGAAGCCGUUAAGUCCGCCGCCUGGGGAGUACGGCCGCAAGGCUGAAACUUA | .......(((((...(.((((.(.(((.(((((((.((((((((((.....(((((((.....)))))))....))))))))..)))))))))...((((((.....(((((((((..(((((((....(((......))).......)))))))..)).......((....)).)))))))....))).)))...))))..))))....((((((...((...((((.........))))...))))))))..........((((((..((((((((((((((.....))))))))))))))...((..)))).....)))))))))).(((......((((....))))....))). | 16S_rRNA |
16S_rRNA-A.fulgidus_domain3 | AAGGAAUUGGCGGGGGAGCACUACAACGGGUGGAGCCUGCGGUUUAAUUGGAUUCAACGCCGGGAAGCUUACCGGGGGAGACAGCGGGAUGAAGGUCGGGCUGAAGACCUUACCAGACUAGCUGAGAGGUGGUGCAUGGCCGCCGUCAGUUCGUACUGUGAAGCAUCCUGUUAAGUCAGGCAACGAGCGAGACCCGCGCCCCCAGUUGCCAGCGGUUCCCUUCGGGGAAGCCGGGCACACUGGGGGGACUGCCGGCGCUAAGCCGGAGGAAGGUGCGGGCAACGGCAGGUCCGUAUGCCCCGAAUCCCCCGGGCUACACGCGGGCUACAAUGGCCGGGACAAUGGGUACCGACCCCGAAAGGGGUAGGUAAUCCCCUAAACCCGGUCUAACCUGGGAUCGAGGGCUGCAACUCGCCCUCGUGAACCUGGAAUCCGUAGUAAUCGCGCCUCAAAAUGGCGCGGUGAAUACGUCCCUGCUCCUUGCACAC | .......(((((.(((((((..((..((((((.((((((((((....((((........))))........(((((((...((((.(......(((.(((.......))).)))...)..))))...((.((((..(((((((((...((((((.((....))...((((......))))..)))))).....((((.(((((((...((..((((((((....))))).)))))....)))))))..((.(((((.....))))).)).....))))....)))).)))...))))))))....)))))))...)).)))))))).)...(((((((.....(((..((...(((....)))...))....))).....)))))))......(....(((((((........)))))))....).....))))).....((((((((.......))))))))......))...)))))))))).)). | 16S_rRNA |
16S_rRNA-A.fulgidus_domain4 | ACCGCCCGUCAAGCCACCCGAGUGGGCCAGGGGCGAGGGGGUGGCCCUAGGCCACCUUCGAGCCCAGGGUCCGCGAGGGGGGCUAAGUCGUAACAAGGUAGCCGUAGGGGAAUCUGCGGCUGGAUCACCUCCU | .(.(..((...((((.(((..(((((((..((((..((((((((((...))))))))))..))))..)))))))..))).))))....))...)..).((((((((((....))))))))))........... | 16S_rRNA |
16S_rRNA-A.pyrophilus_domain2 | UCACUGGGCGUAAAGCGUCCGCAGCCGGUCGGGUAAGCGGGAUGUCAAAGCCCACGGCUCAACCGUGGAAUGGCAUCCCGAACUGCCCGACUUGAGGCACGCCCGGGCAGGCGGAAUUCCCGGGGUAGCGGUGAAAUGCGUAGAUCUCGGGAGGAACACCGAAGGGGAAGCCAGCCUGCUGGGGCUGUCCUGACGGUCAGGGACGAAAGCCGGGGGAGCGAACCGGAUUAGAUACCCGGGUAGUCCCGGC | ................((((...(((.(((((((.(((((((((((.....((((((.....))))))...)))))))))..)))))))))...(((((..((..((((((((...((((((((...(((......)))......))))))))...).......((....)).))))))).))..)).)))...)))...))))....((((((...((...((((.........))))...)))))))) | 16S_rRNA |
16S_rRNA-A.pyrophilus_domain4 | CCGCCCGUCACGCCACGGAAGUCGGUCCGGCCGGAAGUCCCCGAGCUAACCGGCCCUUUUUGGGCCGGGGGCAGGGGCCGAUGGCCGGGCCGGCGACUGGGGCGAAGUCGUAACAAGGUAGCCGUAGGGGAACCUGC | ..(..((...((((.(((..((((((((((((....(.((((..(((..(((((((.....))))))).))).)))).)...))))))))))))..))).))))....))...).........(((((....))))) | 16S_rRNA |
16S_rRNA-B.burgdorferi_domain2 | GGGAUUAUUGGGCGUAAAGGGUGAGUAGGCGGAUAUAUAAGUCUAUGCAUAAAAUACCACAGCUCAACUGUGGACCUAUGUUGGAAACUAUAUGUCUAGAGUCUGAUAGAGGAAGUUAGAAUUUCUGGUGUAAGGGUGGAAUCUGUUGAUAUCAGAAAGAAUACCGGAGGCGAAGGCGAACUUCUGGGUCAAGACUGACGCUGAGUCACGAAAGCGUAGGGAGCAAACAGGAUUAGAUACCCUGGUAGUCUACGCUGUAAACGAUGCACACUUGGUGUUAACUAAAAGUUAGUACCGAAGCUAACGUGUUAAGUGUGCCGCCUGGGGAGUAUGCUCGCAAGAGUGAAAC | ..........(((((...(.((((.(.(((.(((((((.((((((.(((((.....((((((.....))))))...)))))))))..)))))))))...((((((((...((((((((...((((((((...(((......)))......))))))))...).......((....)).)))))))..)))).))))...))))..))))....((((((...((...((((.........))))...))))))))..........((((((..((((((((((...))))))))))...((..)))).....))))))))))...(......((((....))))....) | 16S_rRNA |
16S_rRNA-B.burgdorferi_domain3 | UCAAAGGAAUUGACGGGGGCCCGCACAAGCGGUGGAGCAUGUGGUUUAAUUCGAUGAUACGCGAGGAACCUUACCAGGGCUUGACAUAUAUAGGAUAUAGUUAGAGAUAAUUAUUCCCCGUUUGGGGUCUAUAUACAGGUGCUGCAUGGUUGUCGUCAGCUCGUGCUGUGAGGUGUUGGGUUAAGUCCCGCAACGAGCGCAACCCUUGUUAUCUGUUACCAGCAUGUAAUGGUGGGGACUCAGAUAAGACUGCCGGUGAUAAGUCGGAGGAAGGUGAGGAUGACGUCAAAUCAUCAUGGCCCUUAUGUCCUGGGCUACACACGUGCUACAAUGGCCUGUACAAAGCGAAGCGAAACAGUGAUGUGAAGCAAAACGCAUAAAGCAGGUCUCAGUCCGGAUUGAAGUCUGAAACUCGACUUCAUGAAGUUGGAAUCGCUAGUAAUCGUAUAUCAGAAUGAUACGGUGAAUACGUUCUCGGGCCUUGU | ............(((.(((((((.((..((((((.((((((((((....((((........))))........(((((((......((((((((..(((((((....))))))).((((....))))))))))))..((.((((..((((((.((...(((((((((....)))..((((......))))..)))))).....((((.(((((((...((..(((......)))))....)))))))..((.(((((.....))))).)).....))))....)).).)))...))))))))....)))))))...)).)))))))).)...(((((((.....(((..((...(((....)))...))....))).....)))))))......(....(((((((........)))))))....).....))))).....(((((((.........)))))))......))...)))))))))) | 16S_rRNA |
16S_rRNA-B.burgdorferi_domain4 | ACACACCGCCCGUCACACCACCCGAGUUGAGGAUACCCGAAGCUAUUAUUCUAACCCGUAAGGGAGGAAGGUAUUUAAGGUAUGUUUAGUGAGGGGGGUGAAGUCGUAACAAGGUAGCCGUACUGGAAAGUGCGGCUGGAUCACCUC | .....(.(..((...((((.(((..((((((.(((((....(.((((.((((..(((....))).)))))))).)...))))).))))))..))).))))....))...)..).((((((((((....))))))))))......... | 16S_rRNA |
16S_rRNA-B.subtilis_domain2 | AUUAUUGGGCGUAAAGGGCUCGCAGGCGGUUUCUUAAGUCUGAUGUGAAAGCCCCCGGCUCAACCGGGGAGGGUCAUUGGAAACUGGGGAACUUGAGUGCAGAAGAGGAGAGUGGAAUUCCACGUGUAGCGGUGAAAUGCGUAGAGAUGUGGAGGAACACCAGUGGCGAAGGCGACUCUCUGGUCUGUAACUGACGCUGAGGAGCGAAAGCGUGGGGAGCGAACAGGAUUAGAUACCCUGGUAGUCCACGCCGUAAACGAUGAGUGCUAAGUGUUAGGGGGUUUCCGCCCCUUAGUGCUGCAGCUAACGCAUUAAGCACUCCGCCUGGGGAGUACGGUCGCAAGACUGAAACUCA | .......(((((.....((((.(.(((.(((((((.(((((((((.......((((((.....)))))).....)))))))..)))))))))...((((((((...((((((((...((((((((...(((......)))......))))))))...).......((....)).)))))))..))))).)))...))))..))))....((((((...((...((((.........))))...))))))))..........((((((..((((((((((((......))))))))))))...((..)))).....)))))).))).(((......((((....))))....))). | 16S_rRNA |
16S_rRNA-B.subtilis_domain3 | AAGGAAUUGACGGGGGCCCGCACAAGCGGUGGAGCAUGUGGUUUAAUUCGAAGCAACGCGAAGAACCUUACCAGGUCUUGACAUCCUCUGACAAUCCUAGAGAUAGGACGUCCCCUUCGGGGGCAGAGUGACAGGUGGUGCAUGGUUGUCGUCAGCUCGUGUCGUGAGAUGUUGGGUUAAGUCCCGCAACGAGCGCAACCCUUGAUCUUAGUUGCCAGCAUUCAGUUGGGCACUCUAAGGUGACUGCCGGUGACAAACCGGAGGAAGGUGGGGAUGACGUCAAAUCAUCAUGCCCCUUAUGACCUGGGCUACACACGUGCUACAAUGGACAGAACAAAGGGCAGCGAAACCGCGAGGUUAAGCCAAUCCCACAAAUCUGUUCUCAGUUCGGAUCGCAGUCUGCAACUCGACUGCGUGAAGCUGGAAUCGCUAGUAAUCGCGGAUCAGCAUGCCGCGGUGAAUACGUUCCCGGGCCUUGUACAC | .......(((((.(((((((.((..((((((.((((((((((....((((........))))........(((((((......(((((((....(((((....)))))...((((....))))))))).))..((.((((..((((((.((...(((((((((....)))..((((......))))..)))))).....((((.(((((((...((..((......))))....)))))))..((.(((((.....))))).)).....))))....)).).)))...))))))))....)))))))...)).)))))))).)...(((((((.....(((..((...(((....)))...))....))).....)))))))......(....(((((((........)))))))....).....))))).....(((((((.........)))))))......))...)))))))))).)). | 16S_rRNA |
16S_rRNA-B.subtilis_domain4 | ACCGCCCGUCACACCACGAGAGUUUGUAACACCCGAAGUCGGUGAGGUAACCUUUUAGGAGCCAGCCGCCGAAGGUGGGACAGAUGAUUGGGGUGAAGUCGUAACAAGGUAGCCGUAUCGGAAGGUGCGGCUGGAUCACCUCCUUUCU | ...(..((...((((.(((..((((((..((((....(.((((..(((..(((...))).))).)))).)...))))..))))))..))).))))....))...)....((((((((((....))))))))))............... | 16S_rRNA |
16S_rRNA-C.elegans_domain1 | AAUAGGUUUGGUCCUAGCCUUUCUAUUAACUCUUAGUAGGAUUACACAUGCAAGCAUCCCCGCCCCAGUGAGUCACCCUCUAAAUCACCACGAUCAAAAGGAACAAGCAUCAAGUACGCAGAAAUGCAGCUCAAAACGCUUAGCCUAGCCACACCCCCACGGGAGACAGCAGU | ...(((((.......))))).........................((.(((..(......)......(((......(((....(((.....)))....)))....(((....(((..(((....))).)))......)))..((...))))).(.((....)).)...))))) | 16S_rRNA |
16S_rRNA-C.elegans_domain2 | GAUAAACCUUUAGCAAUAAACGAAAGUUUAACUAAGCCAUACUAACCCCAGGGUUGGUCAAUUUCGUGCCAGCCACCGCGGUCACACGAUUAACCCAAGCCAAUAGAAAUCGGCGUAAAGAGUGUUUUAGAUCAAUCCCCCAAUAAAGCUAAAAUUCACCUG | ........(.(((...(((((....))))).))))...............((((((((.....(((.....((.))))).......)))..))))).................................................................. | 16S_rRNA |
16S_rRNA-C.elegans_domain3 | AGUUGUAAAAAACUCCAGCUGAUAUAAAAUAAACUACGAAAGUGGCUUUAAUAUAUCUGAACACACAAUAGCUAGGACCCAAACUGGGAUUAGAUACCCCACUAUGCCUAGCCCUAAACUUCAACAGUUAAAUUAACAAGACUGCUCGCCAGAACACUACGAGCCACAGCUUAAAACUCAAAGGACCUGGCGGUGCUUCACAUCCUUCUAGAGGAGCCUGUUCUGUAAUCGAUAAACCCCGAUCAACCUCACCACCUCUUGCUCAGCCUAUAUACCGCCAUCUUCAGCAA | .(((......)))....................(.((....)))..........................((((((...((...((((.........))))...))))))))..........(.(((((..........))))).).....((.......((((....)))).....))................................................((((........))))............................................... | 16S_rRNA |
16S_rRNA-C.elegans_domain4 | ACCCUGACGAAGGCCACAAAGUAAGCACAAGUACCCACGUAAAGACGUUAGGUCAAGGUGUAGCCCAUGAGGU | .((((.....))).......)..........(((....)))................................ | 16S_rRNA |
16S_rRNA-C.psittaci_domain2 | UUUAUUGGGCGUAAAGGGCGUGUAGGCGGAAAGGAAAGUUAGAUGUUAAAUCUUGGGGCUCAACCCCAAGCCAGCAUCUAAUACUAUCUUUCUAGAGGGUAGAUGGAGAAAAGGGAAUUCCACGUGUAGCGGUGAAAUGCGUAGAUAUGUGGAAGAACACCAGUGGCGAAGGCGCUUUUCUAAUUUACACCUGACGCUAAGGCGCGAAAGCAAGGGGAGCAAACAGGAUUAGAUACCCUGGUAGUCCUUGCCGUAAACGAUGCAUACUUGAUGUGGAUAGUCUCAACCCUAUCCGUGUCGUAGCUAACGCGUUAAGUAUGCCGCCUGAGGAGUACACUCGCAAGGGUGAAACUCA | .......(((((.....((((.(.(((.((((((..(((((((((((....(((((((.....)))))))..)))))))))..)).))))))...(((((((((..((((((((...((((((((...(((......)))......))))))))...).......((....)).))))))).)))))).)))...))))..))))....((((((...((...((((.........))))...))))))))..........((((((..(((((((((((........)))))))))))...((..)))).....)))))).))).(((......((((....))))....))). | 16S_rRNA |
16S_rRNA-C.psittaci_domain3 | AAAGAAUUGACGGGGGCCCGCACAAGCAGUGGAGCAUGUGGUUUAAUUCGAUGCAACGCGAAGAACCUUACCUGGGCUUGACAUGUAUUUGACCGCGGCAGAAAUGUCGUUUUCCGCAAGGACAGAUACACAGGUGCUGCAUGGCUGUCGUCAGCUCGUGCCGUGAGGUGUUGGGUUAAGUCCCGCAACGAGCGCAACCCUUAUCGUUAGUUGCCAACACUUAGGGUGGGAACUCUAACGAGACUGCCUGGGUUAACCAGGAGGAAGGCGAGGAUGACGUCAAGUCAGCAUGGCCCUUAUGCCCAGGGCUACACACGUGCUACAAUGGCCAGUACAGAAGGUAGCAAUAUCGUGAGAUGGAGCAAAUCCUCAAAGCUGGCCCCAGUUCGGAUUGUAGUCUGCAACUCGACUACAUGAAGUCGGAAUUGCUAGUAAUGGCGUGUCAGCUAUAACGCCGUGAAUACGUUCCCGGGCCUUGUACAC | .......(((((.(((((((.((..((((((.((((((((((....((((........))))........(((((((......((((((((...((((((....))))))..(((....)))))))))))..((.((((..((((((.((...(((((((((....)))..((((......))))..)))))).....((((.(((((((...((..(((.....)))))....)))))))..((.(((((.....))))).)).....))))....)).).)))...))))))))....)))))))...)).)))))))).)...(((((((.....(((..((...(((....)))...))....)))....)))))))......(....(((((((........)))))))....).....))))).....(((((((..........)))))))......))...)))))))))).)). | 16S_rRNA |
16S_rRNA-C.psittaci_domain4 | ACCGCCCGUCACAUCAUGGGAGUUGGUUUUGCCUUAAGUCGUUGACUCAACCUGCAAAGGAGAGAGGCGCCCAAGGUGAGGCUGAUGACUGGGAUGAAGUCGUAACAAGGUAGCCCUACCGGAAGGUGGGGCUGGAUCACCUCCUUU | ...(..((...((((.(((..((((((((((((....(.((((..(((..(((....))).))).)))).)...))))))))))))..))).))))....))...)....((((((((((....))))))))))............. | 16S_rRNA |
16S_rRNA-C.reinhardtii.chloro_domain1 | AUCCAUGGAGAGUUUGAUCCUGGCUCAGGACGAACGCUGGCGGCAUGCUUAACACAUGCAAGUCGAACGAGCAAAGCAAUUUGUGUAGUGGCGAACGGGUGCGUAACGCGUAAGAACCUACCUAUCGGAGGGGGAUAACAUUGGGAAACUGUUGCUAAUACCCCAUACAGCUGAGGAGUGAAAGGUGAAAAACCGCCGAUAGAGGGGCUUGCGUCUGAUUAGCUAGUUGGUGGGGGUAACGGCCUCCCAAGGCCACGAGCAGUAGCUGGUCUGAGAGGAUGAUCAGCCACACUGGGACUGAGACACGGCCCAGACUCCUACGGGAGGCAGCAGUGAGGAAUUUUUCGCAAUGGGCGCAAGCGACGGAGCAAUGCCGCGUGCAGGAAGAAGGCCUGUGGGUCGUAAACUGCUUUUCUCAGAGAAGAAGUUCUGACGGUAUCUGAGGAAUAAGCACCGGCUAACUCUGUGCCAGCAGCCGCGGUAAUACAGAGGGUGCAAGCGUUGUCCGGA | .........(((((.......))))).((((.((((((.(((((((((....(((.(((..(((..((..(((((....)))))...)))))......(((......(((((((..((...(((((((.((((.....((.(((....))).))......)))).....(((....)))....(((.....))).)))))))..)).)))))))(((..(.(((..((((.((((.......))))))))))).....))))..((((((((....))))...))))))).(((((............))))).((((....))))...)))))).).....(.(((...(..((....))).)))).)).))))))..((((......((((....)))).....)))).(..((((((...(.........)....))))))..)...((((((((...(((((.....((.))))).......)))))))))).))))))))))... | 16S_rRNA |
16S_rRNA-C.reinhardtii.chloro_domain2 | AUGAUUGGGCGUAAAGCGUCUGUAGGUGGCUCGUAAAGUCUAAUGUCAAAUACCAGGGCUCAACCUUGGACCGGCAUUGGAGUACUCACGAGCUUGAGUACGGUAGGGGCAGAGGGAAUUCCAUGUGGAGCGGUGAAAUGCGUAGAGAUAUGGAGGAACACCAGUGGCGAAGGCGCUCUGCUGGGCCGAAACUGACACUGAGAGACGAAAGCUGGGGGAGCGAAUAGGAUUAGAUACCCUAGUAGUCCCAGCCGUAAACUAUGGAGACUAAGUGCUGCCGCAAGCAGUGCUGUAGCUAACGCGUUAAGUCUCCCGCCUGGGGAGUAUGCUCGCAAGAGUGAAACUCA | .......(((((...(.((((.(.(((.((((((..(((((((((((.....((((((.....))))))...)))))))))...)).))))))...(((.((((...((((((((...((((((((...(((......)))......))))))))...).......((....)).)))))))..))))..)))...))))..))))....((((((...((...((((.........))))...))))))))..........((((((..((((((((.....))))))))...((..)))).....)))))))))).(((......((((....))))....))). | 16S_rRNA |
16S_rRNA-C.reinhardtii.chloro_domain3 | AAGGAAUUGACGGGACCGCACAAGCGGUGGAUUAUGUGGAUUAAUUCGAUACAACGCGAAGAACCUUACCAGGGUUUGACAUGUCAAGAACCUCUCAGAAAUGGGAGGGUGCCCUAACGGACUUGAACACAGGUGGUGCAUGGCUGUCGUCAGCUCGUGCUGUGAAGUGUAUAGUUAAGUCUCAUAACGAGCGCAACCCUCGUCUUUAGUUGCCAUUUGGUUCUCUAAAGAGACUGCCAGUGUAAGCUGGAGGAAGGUGAGGAUGACGUCAAGUCAGCAUGCCCCUUACAUCCUGGGCUUCACACGUAAUACAAUGGUUGGGACAAUCAGAAGCGACUCGUGAGAGCUAGCGGCUCUGUUAAACCCAACCUCAGUUCGGAUUGUAGGCUGCAACUCGCCUACAUGAAGCCGGAAUCGCUAGUAAUCGCCAGUCAGCUAUAUGGCGGUGAAUACGUUCCCGGGUCUUGUACAC | .......(((((((((((.((..((((((.((((((((((....((((........))))........(((((((......(((((((..(((((((....)))))))...((.....)).))))).))..((.((((..((((((.((...(((((((((....)))....((......))....)))))).....((((.(((((((...((....))....)))))))..((.(((((....))))).)).....))))....)).).)))...))))))))....)))))))...)).)))))))).)...(((((((.....(((..((..(((....)))...))....))).....)))))))......(....(((((((........)))))))....).....))))).....(((((((..........)))))))......))...).)))))))).)). | 16S_rRNA |
16S_rRNA-C.reinhardtii.chloro_domain4 | ACCGCCCGUCACACCAUGGAAGCUGGUUCUGCUCCAAGUCGUUACCCUAACCUUCGGGAGGGGGGCGCCUAAAGCAGGGCUAGUGACUAGGGUGAAGUCGUAACAAGGUAGGGCUACUGGAAGGUGGCCCUGGCUCACCUCCUUC | ...(..((.(.((((.(((..((((((((((((....(.((((.((((..((....)).)))))))).)...))))))))))))..))).))))..).))...)....((((((((((....))))))))))............. | 16S_rRNA |
16S_rRNA-C.reinhardtii.mito_domain1 | AAAUUAGAGUUUGGUGCUGGCUCAGCUUUCAUGCGCCGAGCGGUGGUUUAUACAUGCGAGCUUAAAAGAUUAAGGCCACGAGUGCGUAAUACGCGAGUUUAAAUUUAUUAUACAAAAGUUGCUAGGUGACCCAAUACGGGCAUCGGGCAAAACUCGCGUAGGAUUAGCGAGCUGGGUCGCGACGCCAAUACAGCGGCCCAUGGCUUAUCCUUAGCCUGUCUUAACGGUACUAGGCCACGGUGGCACUGAAAAGGGGCCACGGUUCUUAUGAACCCAGCAGUGUUGAAUUUUGGACAAUCGCUUGAACGGCGGAUCCAGAUGCUGCUUACAAAAUUGUUUGUGAACAC | ......(((((.......)))))..............((((((.......(((.(((..((((....................................................))))......(((.....((.((((............)))).))(((....((....(((((((..............)))))))..))....)))..((((..((....))....))))))).(((((...........))))).((((....))))...)))))).......(.(((...(((((.....))))).))))....)))))).................... | 16S_rRNA |
16S_rRNA-C.reinhardtii.mito_domain2 | CCCCCAAGCACGUGCCAGAAGGGUCGGUAAAACGUGCGGUGUCAGUAUAAAGCGUCUUGACUAGGCAGGCAGCGCGUCUGAGCGUUAAUGGUGAACACUUUAAACGUUGGGUAAUAUUCGGAGGAUCGGUCAAAUGAGAAUAUUCCGGAUGGAAAGCCGAAGGCGAAAGCACCAACAUCAGAGUCACUAAAGCUUCAACGCGUAAGUUUGGGUAGCGAACCGGAUUAGAGACCCGCAGUAGUCCAAACCGUCAACA | .......(((((....................)))))....................................((((..((((.............(((((..(.(((((.(..((((((((...(((......)))......))))))))..)........((....)).))))).).))))).......))))..))))....(((((((...(....(((.........))).....))))))))........ | 16S_rRNA |
16S_rRNA-C.reinhardtii.mito_domain3 | CAUUAUAGUUUUCAAAUCUAUAACGCCUGGUGAUACGGUGGCAACACUAUAAAUCAAAGCAAUUGGCAGCGAUAGAGAUGCGCGGUGGAAUAUGCUGUUUAAAUCGAAUUUACGCGCAAAAUCUUACCACUUUUUAUUAAAAUAGCUCUUGCAUUGCUGAAAAGUUCGAGCGGGACCUCGCCCUUAGUGCCGGUCUUUGCCACGUUUUCUGAACGGUCGAGCAAGUCAUCAUGGGGCUUAUAGAGUGGGCUACAGGCGUAUUACAUUGGACACCCACAAGUUGGAUACCAAAACUGUCCGAAUAUACGGAUUGGAGUAGCAAAACGAGAGAACUAUACAGUUCGUUUGCAUCGUUAUGCCUUGCUGAAACUAGCCUCCAUGAAGAAG | ..((((((.........)))))).....(((.....((((....))))....))).................................((((((((((......((........))..........(((((((...........((.((((..(.(((....((.(((((......)))............)).))......((.((.......)).))....)))....)))))))....)))))))...)).))))))))...(((((((......................))))))).....(....(((((..............(((.((.(((.....))).)).)))...................)))))....)... | 16S_rRNA |
16S_rRNA-C.reinhardtii.mito_domain4 | GAAUCGCGAGUAAUCGUAGAUCAUUAGCGCUACGGUGAAGGUAACCUCUAUUGUGCACACAUUGCCCGUCACCUCCGAUAAUAGUAUUGUACAGGAAGAACUAUGGCUACACUUA | ............(((((((..........)))))))............................................................................... | 16S_rRNA |
16S_rRNA-D.melanogaster_domain4 | ACCGCCCGUCGCUACUACCGAUUGAAUUAUUUAGUGAGGUCUCCGGACGUGAUCACUGUGACGCCUUGCGUGUUACGGUUGUUUCGCAAAAGUUGACCGAACUUGAUUAUUUAGAGGAAGUAAAAGUCGUAACAAGGUUUCCGUAGGUGAACCUGCGGAAGGAUCAUUA | .(.(..((.(..((((..(..((((((.(((.(((..((((..(....((((.(((((((((((.....))))))))).)).).)))....)..))))..))).))).))))))..).))))...).))...)..).((((((((((....))))))))))........ | 16S_rRNA |
16S_rRNA-E.coli_domain2 | AUUACUGGGCGUAAAGCGCACGCAGGCGGUUUGUUAAGUCAGAUGUGAAAUCCCCGGGCUCAACCUGGGAACUGCAUCUGAUACUGGCAAGCUUGAGUCUCGUAGAGGGGGGUAGAAUUCCAGGUGUAGCGGUGAAAUGCGUAGAGAUCUGGAGGAAUACCGGUGGCGAAGGCGGCCCCCUGGACGAAGACUGACGCUCAGGUGCGAAAGCGUGGGGAGCAAACAGGAUUAGAUACCCUGGUAGUCCACGCCGUAAACGAUGUCGACUUGGAGGUUGUGCCCUUGAGGCGUGGCUUCCGGAGCUAACGCGUUAAGUCGACCGCCUGGGGAGUACGGCCGCAAGGUUAAAACUCA | .......(((((...(.((((...(((.(((((((.(((((((((((.....((((((.....))))))...)))))))))..)))))))))...((((((((...((((((((...((((((((...(((......)))......))))))))...).......((....)).)))))))..)))).))))...)))...))))....((((((...((...((((.........))))...))))))))..........((((((..((((((((((((.....))))))))))))...((..)))).....)))))))))).(((......((((....))))....))). | 16S_rRNA |
16S_rRNA-E.coli_domain3 | AAUGAAUUGACGGGGGCCCGCACAAGCGGUGGAGCAUGUGGUUUAAUUCGAUGCAACGCGAAGAACCUUACCUGGUCUUGACAUCCACGGAAGUUUUCAGAGAUGAGAAUGUGCCUUCGGGAACCGUGAGACAGGUGCUGCAUGGCUGUCGUCAGCUCGUGUUGUGAAAUGUUGGGUUAAGUCCCGCAACGAGCGCAACCCUUAUCCUUUGUUGCCAGCGGUCCGGCCGGGAACUCAAAGGAGACUGCCAGUGAUAAACUGGAGGAAGGUGGGGAUGACGUCAAGUCAUCAUGGCCCUUACGACCAGGGCUACACACGUGCUACAAUGGCGCAUACAAAGAGAAGCGACCUCGCGAGAGCAAGCGGACCUCAUAAAGUGCGUCGUAGUCCGGAUUGGAGUCUGCAACUCGACUCCAUGAAGUCGGAAUCGCUAGUAAUCGUGGAUCAGAAUGCCACGGUGAAUACGUUCCCGGGCCUUGUACAC | .......(((((.(((((((.((..((((((.((((((((((....((((........))))........(((((((......(((((((..(((((((....))))))).(.((....)).)))))).))..((.((((..((((((.((...(((((((((....)))..((((......))))..)))))).....((((.(((((((...((..(((.....)))))....)))))))..((.(((((.....))))).)).....))))....)).).)))...))))))))....)))))))...)).)))))))).)...(((((((.....(((..((...(((....)))...))....))).....)))))))......(....(((((((........)))))))....).....))))).....(((((((.........)))))))......))...)))))))))).)). | 16S_rRNA |
16S_rRNA-E.coli_domain4 | ACCGCCCGUCACACCAUGGGAGUGGGUUGCAAAAGAAGUAGGUAGCUUAACCUUCGGGAGGGCGCUUACCACUUUGUGAUUCAUGACUGGGGUGAAGUCGUAACAAGGUAACCGUAGGGGAACCUGCGGUUGGAUCACCUCCUUA | .(.(..((.(.((((.(((..((((((((((((....((((((.((((..((....)).))))))))))...))))))))))))..))).))))..).))...)..).((((((((((....))))))))))............. | 16S_rRNA |
16S_rRNA-F.ananassa_domain3 | AAGGAAUUGACGGAAGGGCACCACCAGGAGUGGAGCCUGCGCUUAAUUUGACUCAACACGGGGAAACUUACCAGGUCCAGACAUAGUAAGGAUUGACAGACUGAGAGCUCUUUCUUGAUUCUAUGGGUGGUGGUGCAUGGCCGUUCUUAGUUGGUGGAGCGAUUUGUCUGGUUAAUUCCGUUAACGAACGAGACCUCAGCCUGCUAACUAGCUAUCGGGAGGUCUCCUCGGGCCAGCUUCUUAGAGGGACUAUGGCCGCUUAGCGAACCAAGUUUGAGGCAAUAACAGGUCUGUCAUGCCCUUAGAUGUUCUGGGCCGCACGCGCGCUACACUGAUGUAUUCAACGAGUCUAUAGCCUUGGCCGACCACGGGGUAAUCUUUGAAAUUUCAUCGUGAUGGGGAUAGAUCAUUGCAAUUGUUGGUCUUCAACGAGGAAUUCCUAGUAAGCGCGAGUCAUCAGCUCGCGUUGACUACGUCCCUGCCCUUUGUACAC | .......(((((.(((((((..((..((((((.(((.(((((....((((........))))........(((((.(....(((((........((.(((........))).))......)))))...((.((((..((((((((....(((.(((((....)))...(((......)))...)).))).....((((.(((.((((..((((..(((((....))).))....))))..))))))).....(.((......)).)........)))).....))).)))...).))))))).....).)))))...))..))).))).)...((((.(......(((.......((..(........)..))....)))......).))))......(....((((((..........))))))....).....))))).....((((((((.......))))))))......))...)))))))))).)). | 16S_rRNA |
16S_rRNA-F.ananassa_domain4 | ACCGCCCGUCGCUCCUACCGAUUGAAUGGUCCGGUGAAGUUGUUCGGAUCGCGGCGACGGGGGGCCGGUUCGCUGCCCGCGACGUCGCGAGAAGUUCCACUGAACCUUAUCAUUUAGAGGAAGGAGAAGUCGUAACAAGGUUUCCGUAGGUGAACCUGCGGAAGGAUCAUUG | .(.(..((.(.(((((.((..(.(((((((..(((..(((.(..(...((((((((.((.(((..(((....)))))).)).))))))))...)..).)))..)))..))))))))..)).)))))..).))...)..).((((((((((....))))))))))........ | 16S_rRNA |
16S_rRNA-G.intestinalis_domain1 | CAUCCGGUCGAUCCUGCCGGAGCGCGACGCUCUCCCCAAGGACGAAGCCAUGCAUGCCCGCUCACCCGGGACGCGGCGGACGGCUCAGGACAACGGUUGCACCCCCCGCGGCGGUCCCUGCUAGCCGGACACCGCUGGCAACCCGGCGCCAAGACGUGCGCGCAAGGGCGGGCGCCCGCGGGCGAGCAGCGUGACGCAGCGACGGCCCGCCCGGGCUUCCGGGGCAUCACCCGGUCGGCGCGGUCGCGGCGCGCCGAGGGCCCGACGCCUGGCGGAGAAUCAGGGUUCGACUCCGGAGAGCGGGCCUGCGAGACGGCCCGCACAUCCAAGGACGGCAGCAGGCGCGGAACUUGCCCAAUGCGCGGCGCGCGAGGCAGCGACGGGGAGCGCGCGAGCGAGGCGGGCCCACAGCCCCCGCCGCGGAGCCGAGGGCAAGGUCUGGUGCCAGCAGCCGCGGUAAUUCCAGCUCGGCGAGCGUCGCGCGG | ...(((((.......))))).((((((((((.(((((..((.....(((.(((..((.(((...........)))))......(((.......(((..(...((...((((..............((.....((((((....))))))......))..................................................))))..)).)..))).(((....(((..((((((((.......)))))))))))......)))...((((((((....))))...))))))).(((((((........))))))).(.((....)).)...)))))).).....(.(((...(((((...))))).)))).)...)))))..((....))..((((((.........)))))).....(((((((((.....((((.....((.))))).......)))))))))).)))))))))).. | 16S_rRNA |
16S_rRNA-G.intestinalis_domain2 | CGCUGCUGCAGUUGAAACGCCCGUAGUUGGCCCCCCGCCGCCACGAGGAAACGGGAGCGCUCCAGGCAGGCCCGUUGGACCCGCCGCGUGGGACCGCGCAGCGGGCCGGCGCGCCGCGGCAGCCCCGAGGAGAGCGGGCGGGGGCACCGGUACCGGCCGGGGACGGGUGAAACAGGAUGAUCCCGCCGAGACCGCCGGCCGCGCAGGCGCCUGCCAAGACCGCCUCUGUCAAUCAAGGGCGAAGGCCGGGGGCUAGAAGGCGAUCAGACACCACCGUAUUCCCGGCCGUAAACGGUGCCGCCCCGCGGCCGGCGCGCGCGUCCCGCCGGCCGCCCAGGGAAACCGGGAGGCUCCGGGCUCUGGGGGGAGUAUGGCCGCAAGGCUGAAACUUG | ........(((((.....((((...(((............(((((.........................................))))).........((((((....)).)))).............(((((((.(...((((..((...((((.((...(.(......).)......)).))))...)).......((....))...))))..).)))).)))...)))...))))....((((((....(...((.(.........).))...).))))))..........((((((..(((.((((((.........)))))).)))...((..))))....)))....))).))).(((......((((....))))....))). | 16S_rRNA |
16S_rRNA-G.intestinalis_domain3 | AAGGCAUUGACGGAGGGGUACCACCAGACGUGGAGUCUGCGGCUCAAUCUGACUCAACGCGCGCACCUCACCAGGCCCGGACGCGCGGAGGACCGACAGCCGGGCGCGCUUUCGCGAUCGCGCGGGCGGUGGUGCAUGGCCGCUCCCAGCCCGUGGCGCGAGCCGUCUGCUCCAUUGCGACAACGAGCGAGACCCCGGCCGCGGGCGCCGCGGGACGGCCCGCGCGAGCGGGAGGACGGCGGGGCGAUAGCAGGUCUGUGAUGCCCUCAGACGCCCUGGGCCGCACGCGCGCUACACUGGCGGGGCCAGCCGGCGCGCGCGAGGACGCGCGGAGCCCCCGCCGUGGCCGGGACCGCGGGCUGGAACGCCCCCGCGCACCAGGAAUGUCUUGUAGGCGCCCGCCCCCACCGCGCGCCGGACGCGUCCCUGCCCCUUGUACAC | .......(((((.(((((((..((..((((((.(((.((((((....(.((........)).).......(((((.(....(((((.......(((.(((.......))).))).....)))))...((.((((..((((((((....((.((((((....)))...(((......)))...))).)).....((((.((((((...))))))..(..(((((....)))))..)....)))).....))).)))...).))))))).....).)))))...)).)))).))).)...((((((.....((((((..(....)..))).)))....))))))......(....((.((((......)))).))....).....))))).....(((((.((.......)).)))))......))...)))))))))).)). | 16S_rRNA |
16S_rRNA-G.intestinalis_domain4 | ACCGCCCGUCGCUCCUACCGACUGGGCGCGGCGGCGAGCGCCCCGGACGCGCGAAGGGCCGCGAGCCCCCGCGCCUGGAGGAAGGAGAAGUCGUAACAAGGUAUUCCGUAGGUGAACCUGCGGAUGGAUCCCUC | ...(..((.(.(((((.((..(.((((((((.(((..(((.(((...........))).)))..))).)))))))))..)).)))))..).))...)....((.((((((((....))))))))))........ | 16S_rRNA |
16S_rRNA-H.sapiens.mito_domain1 | AAUAGGUUUGGUCCUAGCCUUUCUAUUAGCUCUUAGUAAGAUUACACAUGCAAGCAUCCCCGUUCCAGUGAGUUCACCCUCUAAAUCACCACGAUCAAAAGGAACAAGCAUCAAGCACGCAGCAAUGCAGCUCAAAACGCUUAGCCUAGCCACACCCCCACGGGAAACAGCAGUGAUUAACCUUUAGCAAUAAACGAAAGUUUAACUAAGCUAUACUAACCCCAGGGUUGGUCAAUUUCGUGCCAGCCACCGCGGUCACACGAUUAACCCAAGUCAAUAGAA | ...(((((.......))))).((((((.(((.(((((((((...(((.(((..(......)......(((.......(((....(((.....)))....)))....(((....(((..(((....))).)))......)))..((...)))))...((....)).....)))))).).....(.(((...(((((....))))).)))).)).)))))).....((((((((.....(((.....((.))))).......)))..))))).))).)))))). | 16S_rRNA |
16S_rRNA-H.sapiens.mito_domain2 | CCCGGCGUAAAGAGUGUUUUAGAUCACCCCCUCCCCAAUAAAGCUAAAACUCACCUGAGUUGUAAAAAACUCCAGUUGACACAAAAUAGACUACGAAAGUGGCUUUAACAUAUCUGAACACAGAAUAGCUAAGACCCAAACUGGGAUUAGAUACCCCACUAUGCUUAGCCCUAAACCUCAACAGUUAAAUCAACAAAACUGCUCGCCAGAACACUACGAGCCACAGCUUAAAACUCA | ...(((((......(((...(((...............(((((((.....(((.((..(((......)))...)).))).....).....(.((....))))))))).....)))....))).....((((((...((...((((.........))))...))))))))..........(.(((((......))..))))).).))).((.......((((....)))).....)). | 16S_rRNA |
16S_rRNA-H.sapiens.mito_domain3 | AAGGACCUGGCGGUGCUUCAUAUCCCUCUAGAGGAGCCUGUUCUGUAAUCGAUAAACCCCGAUCAACCUCACCACCUCUUGCUCAGCCUAUAUACCGCCAUCUUCAGCAAACCCUGAUGAAGGCUACAAAGUAAGCGCAAGUACCCACGUAAAGACGUUAGGUCAAGGUGUAGCCCAUGAGGUGGCAAGAAAUGGGCUACAUUUUCUACCCCAGAAAACUACGAUAGCCCUUAUGAAACUUAAGGGUCGAAGGUGGAUUUAGCAGUAAACUAAGAGUAGAGUGCUUAGUUGAACAGGGCCCUGAAGCGCGUACAC | .......(((((.(((((((...((..((((((.((((((((((...((((........))))........(((((((.......((.((((..((((((.(.(..((..(((((.....))).......))..)).....(((....)))...).).).)))...))))))))....)))))))..)).)))))))).)...((((.....)))).....(..(.(((((((.......))))))).)..).....))))).....(((((((.........)))))))......))...)))))))))).)). | 16S_rRNA |
16S_rRNA-H.sapiens.mito_domain4 | ACCGCCCGUCACCCUCCUCAAGUAUACUUCAAAGGACAUUUAACUAAAACCCCUACGCAUUUAUAUAGAGGAGACAAGUCGUAACAUGGUAAGUGUACUGGAAAGUGCACUUGGACGAAC | ...(..((.(...((((((...((.......................................))..))))))....).))...)....((((((((((....))))))))))....... | 16S_rRNA |
16S_rRNA-H.sapiens_domain3 | AAGGAAUUGACGGAAGGGCACCACCAGGAGUGGAGCCUGCGGCUUAAUUUGACUCAACACGGGAAACCUCACCCGGCCCGGACACGGACAGGAUUGACAGAUUGAUAGCUCUUUCUCGAUUCCGUGGGUGGUGGUGCAUGGCCGUUCUUAGUUGGUGGAGCGAUUUGUCUGGUUAAUUCCGAUAACGAACGAGACUCUGGCAUGCUAACUAGUUACGCGACCCCCGAGCGGUCGGCGUCCCCCAACUUCUUAGAGGGACAAGUGGCGUUCAGCCACCCGAGAUUGAGCAAUAACAGGUCUGUGAUGCCCUUAGAUGUCCGGGGCUGCACGCGCGCUACACUGACUGGCUCAGCGUGUGCCUACCCUACGCCGGCAGGCGCGGGUAACCCGUUGAACCCCAUUCGUGAUGGGGAUCGGGGAUUGCAAUUAUUCCCCAUGAACGAGGAAUUCCCAGUAAGUGCGGGUCAUAAGCUUGCGUUGAUUAAGUCCCUGCCCUUUGUACAC | .......(((((.(((((((..((..((((((.(((.((((((....((((........))))........(((((.(....(((((........((.(((........))).))......)))))...((.((((..((((((((....(((.(((((....)))...(((......)))...)).))).....(.((.(.(.((((..((((....(((..((((....)))).)))....))))..))))).)..(..(((((.....)))))..)....)).)....))).)))...).))))))).....).)))))...)).)))).))).)...((.(((......(((.......((..((((....))))..)).....)))......))).))......(.....(((((..........))))).....).....))))).....((((((((.......))))))))......))...)))))))))).)). | 16S_rRNA |
16S_rRNA-H.sapiens_domain4 | ACCGCCCGUCGCUACUACCGAUUGGAUGGUUUAGUGAGGCCCUCGGAUCGGCCCCGCCGGGGUCGGCCCACGGCCCUGGCGGAGCGCUGAGAAGACGGUCGAACUUGACUAUCUAGAGGAAGUAAAAGUCGUAACAAGGUUUCCGUAGGUGAACCUGCGGAAGGAUCAUUA | ...(..((.(..((((.((..(.((((((((.(((..((((.((...(((((.((((((((((((.....))))))))))))...)))))...)).))))..))).)))))))))..)).))))...).))...)....((((((((((....))))))))))........ | 16S_rRNA |
16S_rRNA-H.volcanii_domain1 | AUUCCGGUUGAUCCUGCCGGAGGUCAUUGCUAUUGGGGUCCGAUUUAGCCAUGCUAGUUGCACGAGUUCAUACUCGUGGCGAAAAGCUCAGUAACACGUGGCCAAACUACCCUACAGAGAACGAUAACCUCGGGAAACUGAGGCUAAUAGUUCAUACGGGAGUCAUGCUGGAAUGCCGACUCCCCGAAACGCUCAGGCGCUGUAGGAUGUGGCUGCGGCCGAUUAGGUAGACGGUGGGGUAACGGCCCACCGUGCCGAUAAUCGGUACGGGUUGUGAGAGCAAGAGCCCGGAGACGGAAUCUGAGACAAGAUUCCGGGCCCUACGGGGCGCAGCAGGCGCGAAACCUUUACACUGCACGCAAGUGCGAUAAGGGGACCCCAAGUGCGAGGGCAUAUAGUCCUCGCUUUUCUCGACCGUAAGGCGGUCGAGGAAUAAGAGCUGGGCAAGACCGGUGCCAGCCGCCGCGGUAAUACCGGCAGCUCAAGUGAUGACCGAU | ...(((((.......))))).((((((((((.((((((((((.....(((.(((..(((..((((((....)))))))))......(((.......(((((((..((...(((((((.((((.....((((((....))))))......))))....(((((((..((......)).)))))))......((....)).)))))))..))))))))).(((....(((..((((((((.......)))))))))))......)))..((((((((....))))...))))))).((((((..........)))))).((((....))))...)))))).).....(.(((...(((((....))))).)))).)))))))))..((((((((.....)))))))).(..(((((((.......)))))))..)...(((((((((....((((.....((.))))).......)))))))))).))))))))))... | 16S_rRNA |
16S_rRNA-H.volcanii_domain2 | AUUAUUGGGCCUAAAGCGUCCGUAGCCGGCCACGAAGGUUCAUCGGGAAAUCCGCCAGCUCAACUGGCGGGCGUCCGGUGAAAACCACGUGGCUUGGGACCGGAAGGCUCGAGGGGUACGUCCGGGGUAGGAGUGAAAUCCCGUAAUCCUGGACGGACCACCGAUGGCGAAAGCACCUCGAGAAGACGGAUCCGACGGUGAGGGACGAAAGCUAGGGUCUCGAACCGGAUUAGAUACCCGGGUAGUCCUAGCUGUAAACGAUGCUCGCUAGGUGUGACACAGGCUACGAGCCUGUGUUGUGCCGUAGGGAAGCCGAGAAGCGAGCCGCCUGGGAAGUACGUCCGCAAGGAUGAAACUUA | .......(((((.....((((.(.(((.((((((..(((((((((((....(((((((.....)))))))...)))))))))..)).))))))...((((((.....(((((((((..((((((((...(((......)))......))))))))..)).......((....)).)))))))....))).)))...))))..))))....((((((....(...((((.........))))...).))))))..........((((((..((((((((((((((.....))))))))))))))...((..)))).....)))))).))).(((......((((....))))....))). | 16S_rRNA |
16S_rRNA-H.volcanii_domain3 | AAGGAAUUGGCGGGGGAGCACUACAACCGGAGGAGCCUGCGGUUUAAUUGGACUCAACGCCGGACAUCUCACCAGCUCCGACUACAGUGAUGACGAUCAGGUUGAUGACCUUAUCACGACGCUGUAGAGAGGAGGUGCAUGGCCGCCGUCAGCUCGUACCGUGAGGCGUCCUGUUAAGUCAGGCAACGAGCGAGACCCGCACUUCUAAUUGCCAGCAGCAGUUUCGACUGGCUGGGUACAUUAGAAGGACUGCCGCUGCUAAAGCGGAGGAAGGAACGGGCAACGGUAGGUCAGUAUGCCCCGAAUGAGCUGGGCUACACGCGGGCUACAAUGGUCGAGACAAUGGGUUGCUAUCUCGAAAGAGAACGCUAAUCUCCUAAACUCGAUCGUAGUUCGGAUUGAGGGCUGAAACUCGCCCUCAUGAAGCUGGAUUCGGUAGUAAUCGCAUUUCAAUAGAGUGCGGUGAAUACGUCCCUGCUCCUUGCACACA | .......(((((.(((((((..((..((((((.((((((((((....((((........))))........(((((((...((((((((.....(((.(((.......))).)))....))))))))...((.((((..(((((((((...((((((.((....))...((((......))))..)))))).....(((..(((((((...((..(((((((....)))).)))))....)))))))..((.(((((.....))))).))......)))....)))).)))...))))))))....)))))))...)).)))))))).)...(((((((.....(((..((...(((....)))...))....))).....)))))))......(....(((((((........)))))))....).....))))).....((((((((.......))))))))......))...)))))))))).)).. | 16S_rRNA |
16S_rRNA-H.volcanii_domain4 | CCGCCCGUCAAAGCACCCGAGUGAGGUCCGGAUGAGGCCACCACACGGUGGUCGAAUCUGGGCUUCGCAAGGGGGCUUAAGUCGUAACAAGGUAGCCGUAGGGGAAUCUGCGGCUGGAUCACCUCCUG | ..(..((...((((.(((..(((((((((((((..(((((((....)))))))..)))))))))))))..))).))))....))...)....((((((((((....))))))))))............ | 16S_rRNA |
16S_rRNA-M.polymorpha_domain2 | UGCGAUUAUGACAAGACUCGAAGAAGAAGCCCCGGCUAACUCCGUGCCAGCAGCCGCGGUAAGACGGGGGGGGCAAGUGUUAUUCGGAAUGACUAGGCGUAAAGGGCACGUAGGCGGUGAAUCCAGUUGAAAGUGAAAGUCGCCAGCUCAACUGGCGGAAUGCUUUCAAAACCAAUUUACUAGAGUAAGGCAUAGAGGAAAGCGGAAUUUCGUGUGUAGCGAUAAAAUGCAAAAAUAUACGAAGGAACGCCAAAAGCGAAGGCAGCUUUCUGGUUCUUUAACUGACGCUAAAGUGCGAAAGCAUGGGGAGCAAACAGGAUUAGAUACCCUGGUAGUCCAUGCUGUAAACGAUGA | .(.........)................(((((......(((((....................))))))))))...............................((((...((((((((((...((((((((((.....(((((.......)))))...)))))))))..)..)))))).....(((((.(....((((((((...((((((((...(((......)))......))))))))...).......((....)).)))))))...)))))).....))))...))))....(((((((...(...((((.........))))...))))))))............ | 16S_rRNA |
16S_rRNA-M.polymorpha_domain3 | GUGUUCGUUCUUGGUCUACUGAUAUCGCACUCUUUUGGGCUGACUUAAGCUCGGCUUAAUGCUUAAAUUACUGCAAAGGUAGUGUGACUCGAUUGUUUUCUUCAAGUUCCAACAAUCGUGAAAAAUAUGUGAUGAUCAGGGGCUGAGCUAACGCGUUAAACACUCCGCCUGGGGAGUACGGUCGCAAGGCUGAAACUCAAAGAAUUGACGGGGGCCUGCACAAGCGGUGGAGCAUGUGGUUUAAUUCGAUUCAACGCGCAAAACCUUACCAGCCCUUGACAUAUGAAUAAGUGUGCUUGUCCUUAACGGGAUGGUACGAAAAUUCAUACAGGUGUUGCAUGGCUGUCGUCAGCUCGUGUCUUGAGACGUUGGGUUAAGUCCUAUAACGAGCGCAACCCUUGUUUUGUGUUGCUAAGACAUGCUUUGGUUCAAUCCUUGACCACUGGAGACUGACGAAGACUACGCCGUGAAAAUGGAGGAUACCGA | .((((.((((((((((.....................................................................................................................))))))))))...((....))....))))........(((......((((....))))....)))..............................................(.((........)).).....................((((((........(((((.....)))))............)))))).......................(((((((((....)))..((((......))))..))))))............................................................................................... | 16S_rRNA |
16S_rRNA-M.polymorpha_domain4 | CGAGCUAAGUUUUUGCAAACGCCGUGUGGCUCAUUCUGAAAAGAAUAUGACCAUACAAAGUUUUCAUACGGUAUUCUCCGACGAACGAAGCUCUCAGAGCAUUGUACACUUCACACUGAGGAACUCGAUCUUAGUCAAAAUGA | ............................................................................................................................................... | 16S_rRNA |
16S_rRNA-P.occultum_domain2 | AUUACUGGGCCUAAAGCGCCCGUAGCCGGCCCGGUAAGUCCCCCCCUAAAGCCCCGGGCUCAACCCGGGGAGUGGGGGGGAUACUGCCGGGCUAGGGGGCGGGAGAGGCCGAGGGUACUCCCGGGGUAGGGGCGAAAUCCGAUAAUCCCGGGAGGACCACCAGUGGCGAAGGCGCUCGGCUGGAACGCGCCCGACGGUGAGGGGCGAAAGCCGGGGGAGCAAACCGGAUUAGAUACCCGGGUAGUCCCGGCUGUAAACGAUGCGGGCUAGGUGUUGGGCGGGCUUGGAGCCCGCCCAGUGCCGCAGGGAAGCCGUUAAGCCCGCCGCCUGGGGAGUACGGCCGCAAGGCUGAAACUUA | .......(((((...(.((((.(.(((.(((((((.((((((((((.....(((((((.....)))))))...))))))))..)))))))))...((((((.....(((((((((..((((((((...(((......)))......))))))))..)).......((....)).)))))))....))).)))...))))..))))....((((((...((...((((.........))))...))))))))..........((((((..((((((((((((((.....))))))))))))))...((..)))).....)))))))))).(((......((((....))))....))). | 16S_rRNA |
16S_rRNA-P.occultum_domain3 | AAGGAAUUGGCGGGGGAGCACCACAAGGGGUGGAGCCUGCGGCUUAAUUGGAGUCAACGCCGGGAAUCUUACCGGGGGCGACAGCAGGAUGACGGCCAGGCUGACGACCUUGCCCGACACGCUGAGAGGAGGUGCAUGGCCGUCGCCAGCUCGUGCCGUGAGGUGUCCGGUUAAGUCCGGCAACGAGCGAGACCCCCACCCCUAGUUGCUACCCCGGGGCCACCCCGGGGGCACACUAGGGGGACUGCCGCCGUCCAAGGCGGAGGAAGGAGGGGGCCACGGCAGGUCAGCAUGCCCCGAAUCCCCCGGGCUGCACGCGGGCUACAAUGGCGGGGACAGCGGGAUCCGACCCCGAAAGGGGGAGGCAAUCCCUUAAACCCCGCCGCAGUUGGGAUCGAGGGCUGCAACUCGCCCUCGUGAACGCGGAAUCCCUAGUAACCGCGCGUUAGCAUCGCGCGGUGAAUACGUCCCUGCUCCUUGCACAC | .......(((((.((.((((..((..((((((.((((((((((....((((........))))........(((((((...((((.(......(((.(((.......))).)))...)..))))...((.((((..(((((((((...(((((((((....)))..((((......))))..)))))).....((((.(((((((...((..(((((((...)))))))))....)))))))..((.(((.(......).))).)).....))))....)))).)))...))))))))....)))))))...)).)))))))).)...(((((((.....(((..((...(((....)))...))....))).....)))))))......(....(((((((........)))))))....).....))))).....((((((((.......))))))))......))...)))).))))).)). | 16S_rRNA |
16S_rRNA-P.occultum_domain4 | ACCGCCCGUCGCUCCACCCGAGCGGGGGAGGGGUGAGGCCCCGUCCCUCGCCAGGGCGGGGUCGAACCUCUCCCCCGCGAGGGGGGAGAAGUCGUAACAAGGUAGCCGUAGGGGAACCUGCGGCUGGAUCACCUCCU | .(.(..((...((((.(((..(((((((((((((..((((((((((.......))))))))))..)))))))))))))..))).))))....))...)..).((((((((((....))))))))))........... | 16S_rRNA |
16S_rRNA-P.staleyi_domain2 | UUUACUGGGCUUAAAGAGUUCGUAGGCGGUCUUGUAAGUGGGGUGUGAAAUCCCUCGGCUCAACCGAGGAACUGCGCUCCAAACUACAAGACUUGAGGGGGAUAGAGGUAAGCGGAACUGAUGGUGGAGCGGUGAAAUGCGUUGAUAUCAUCAGGAACACCGGAGGCGAAGGCGGCUUACUGGGUCCUUUCUGACGCUGAGGAACGAAAGCUAGGGGAGCAAACGGGAUUAGAUACCCCGGUAGUCCUAGCCGUAAACGAUGAGCACUGGACCGGAGCUCUGCACAGGGUUUCGGUCGUAGCGAAAGUGUUAAGUGCUCCGCCUGGGGAGUAUGGUCGCAAGGCUGAAACUCA | .......(((((...(.((((.(.(((.(((((((.(((((((((((.....((((((.....))))))...)))))))))..)))))))))...((((((((...((((((((...((((((((...(((......)))......))))))))...).......((....)).)))))))..)))).))))...))))..))))....((((((...((...((((.........))))...))))))))..........((((((..((((((((((((....))))))))))))...((..)))).....)))))))))).(((......((((....))))....))). | 16S_rRNA |
16S_rRNA-P.staleyi_domain3 | AAGGAAUUGACGGGGGCUCACACAAGCGGUGGAGGAUGUGGCUUAAUUCGAGGCUACGCGAAGAACCUUAUCCUAGUCUUGACAUGCUUAGGAAUCUUCCUGAAAGGGAGGAGUGCUCGCAAGAGAGCCUUUGCACAGGUGCUGCAUGGCUGUCGUCAGCUCGUGUCGUGAGAUGUCGGGUUAAGUCCCUUAACGAGCGAAACCCUUGUCCUUAGUUACCAGCGCGUCAUGGCGGGGACUCUAAGGAGACUGCCGGUGUUAAACCGGAGGAAGGUGGGGAUGACGUCAAGUCCUCAUGGCCUUUAUGAUUAGGGCUGCACACGUCCUACAAUGGUGCACACAAAGCGACGCAAACUCGUGAGAGCCAGCUAAUCGCAAAAAAUGUACCUCAGUUCGGAUUGCAGGCUGCAACUCGCCUGCAUGAAGCUGGAAUCGCUAGUAAUCGCGGGUCAGCAUACCGCGGUGAAUAUGUUCCUGAGCCUUGUACAC | .......(((((.(((((((.((..((((((.((((((((((....((((........)))).........(((((((......(((..(((..(((((((....))))))).(.(((....))).))))..)))..((.((((..((((((.((...(((((((((....)))...(((......)))...)))))).....((((.(((((((...((..(((......)))))....)))))))..((.(((((.....))))).)).....))))....)).).)))...))))))))....)))))))...)).)))))))).)...((((((......(((..((...(((....)))...))....)))......))))))......(....(((((((........)))))))....).....))))).....(((((((.........)))))))......))...)))))))))).)). | 16S_rRNA |
16S_rRNA-P.staleyi_domain4 | ACCGCCCGUCAAGCCACGAAAGUGGGGGGGACCCAACAGCGCUGCCGUAACCGCAAGGAACAAGGCGCCUAAGGUCAACUCCGUGAUUGGGACUAAGUCGUAACAAGGUAGCCGUAGGGGAACCUGCGGCUGGAUCACCUCCUUUCU | .(.(..(....((.(.(((..((((((..((((.....(((((...((..((....)).))..)))))....))))..))))))..))).).)).....)...)..).((((((((((....))))))))))............... | 16S_rRNA |
16S_rRNA-S.cerevisiae_domain3 | AGGAAUUGACGGAAGGGCACCACCAGGAGUGGAGCCUGCGGCUUAAUUUGACUCAACACGGGGAAACUCACCAGGUCCAGACACAAUAAGGAUUGACAGAUUGAGAGCUCUUUCUUGAUUUUGUGGGUGGUGGUGCAUGGCCGUUCUUAGUUGGUGGAGUGAUUUGUCUGCUUAAUUGCGAUAACGAACGAGACCUUAACCUACUAAAUAGUGGUGCUAGCAUUUGCUGGUUAUCCACUUCUUAGAGGGACUAUCGGUUUCAAGCCGAUGGAAGUUUGAGGCAAUAACAGGUCUGUGAUGCCCUUAGACGUUCUGGGCCGCACGCGCGCUACACUGACGGAGCCAGCGAGUCUAACCUUGGCCGAGAGGUCUUGGUAAUCUUGUGAAACUCCGUCGUGCUGGGGAUAGAGCAUUGUAAUUAUUGCUCUUCAACGAGGAAUUCCUAGUAAGCGCAAGUCAUCAGCUUGCGUUGAUUACGUCCCUGCCCUUUGUACACAC | ......(((((.(((((((..((..((((((.(((.((((((....((((........))))........(((((.(....(((((........((.(((........))).))......)))))...((.((((..((((((((....(((.(((((....)))...(((......)))...)).))).....((((.(((.((((..(((((.((((((....))))))...)))))..)))))))..((((((((.....)))))))).....)))).....))).)))...).))))))).....).)))))...)).)))).))).)...(((((((.....(((.....((..((((....))))..))....)))......)))))))......(....((((((..........))))))....).....))))).....((((((((.......))))))))......))...)))))))))).))... | 16S_rRNA |
16S_rRNA-S.cerevisiae_domain4 | CGCCCGUCGCUAGUACCGAUUGAAUGGCUUAGUGAGGCCUCAGGAUCUGCUUAGAGAAGGGGGCAACUCCAUCUCAGAGCGGAGAAUUUGGACAAACUUGGUCAUUUAGAGGAACUAAAAGUCGUAACAAGGUUUCCGUAGGUGAACCUGCGGAAGGAUCAUUA | .(..((.(..((((.((..(.((((((((.(((..(.((..(...(((((((.((((.((((....)))).)))).)))))))...)..)).)..))).)))))))))..)).))))...).))...)....((((((((((....))))))))))........ | 16S_rRNA |
16S_rRNA-T.gondii_domain3 | AAGGAAUUGACGGAAGGGCACCACCAGGCGUGGAGCCUGCGGCUUAAUUUGACUCAACACGGGGAAACUCACCAGGUCCAGACAUAGGAAGGAUUGACAGAUUGAUAGCUCUUUCUUGAUUCUAUGGGUGGUGGUGCAUGGCCGUUCUUAGUUGGUGGAGUGAUUUGUCUGGUUAAUUCCGUUAACGAACGAGACCUUAACCUGCUAAAUAGGAUCAGGAACUUCGUGUUCUUGUAUCACUUCUUAGAGGGACUUUGCGUGUCUAACGCAAGGAAGUUUGAGGCAAUAACAGGUCUGUGAUGCCCUUAGAUGUUCUGGGCUGCACGCGCGCUACACUGAUGCAUCCAACGAGUUUAUAACCUUGGCCGAUAGGUCUAGGUAAUCUUGUGAGUAUGCAUCGUGAUGGGGAUAGAUUAUUGCAAUUAUUAAUCUUCAACGAGGAAUGCCUAGUAGGCGCAAGUCAGCACGUUGCGCCGAUUACGUCCCUGCCCUUUGUACAC | .......(((((.(((((((..((..((((((.(((.((((((....((((........))))........(((((.(....(((((........((.(((........))).))......)))))...((.((((..((((((((....(((.(((((....)))...(((......)))...)).))).....((((.(((.((((..((((((((((((.....))))))).))).))..)))))))..((((((((.....)))))))).....)))).....))).)))...).))))))).....).)))))...)).)))).))).)...(((((((.....(((.......((..((((....))))..))....)))......)))))))......(....((((((..........))))))....).....))))).....(((((((.........)))))))......))...)))))))))).)). | 16S_rRNA |
16S_rRNA-T.gondii_domain4 | ACCGCCCGUCGCUCCUACCGAUUGAGUGUUCCGGUGAAUUAUUCGGACCGUUUUGUGGCGCGUUCGUGCCCGAAAUGGGAAGUUUUGUGAACCUUAACACUUAGAGGAAGGAGAAGUCGUAACAAGGUUUCCGUAGGUGAACCUGCGGAAGGAUCAUUC | .(.(..((.(.(((((.((..(.(((((((..(((..((.(..(...((((((((.(((((....)))))))))))))...)..).))..)))..))))))))..)).)))))..).))...)..).((((((((((....))))))))))........ | 16S_rRNA |
16S_rRNA-T.maritima_domain2 | UUUACUGGGCGUAAAGGGGGCGUAGGCGGCCUGGUGUGUCGGAUGUGAAAUCCCACGGCUCAACCGUGGGGCUGCAUCCGAAACUACCAGGCUUGGGGGCGGUAGAGGGAGACGGAACUGCCGGUGUAGGGGUGAAAUCCGUAGAUAUCGGCAGGAACGCCGGUGGGGAAGCCGGUCUCCUGGGCCGACCCCGACGCUGAGGCCCGAAAGCCAGGGGAGCAAACCGGAUUAGAUACCCGGGUAGUCCUGGCUGUAAACGAUGCCCACUAGGUGUGGGGGGGUAAUCCCUCCGUGCUGAAGCUAACGCGUUAAGUGGGCCGCCUGGGGAGUACGCCCGCAAGGGUGAAACUCAAAGGAAUUGACGGGGGCCCGCACAAGCGGUGGAGCGUGUGGUUUAAUUGGAUGCUAAGCCAAGAACCUUACCAGGGCUUGACAUGCCGGU | .......(((((...(.((((.(.(((.(((((((..((((((((((....(((((((.....)))))))..)))))))))..).)))))))...((((((((...((((((((...((((((((...(((......)))......))))))))...).......((....)).)))))))..)))).))))...))))..))))....((((((...((...((((.........))))...))))))))..........((((((..((((((((((((...))))))))))))...((..)))).....)))))))))).(((......((((....))))....)))...............................................((((........))))............................ | 16S_rRNA |
16S_rRNA-T.maritima_domain3 | GGUACCUCCCCGAAAGGGGUAGGGACCCAGUCCUUCGGGACUGGGAGCCGGCACAGGUGGUGCACGGCCGUCGUCAGCUCGUGCCGUGAGGUGUUGGGUUAAGUCCCGCAACGAGCGCAACCCCUGCCCCUAGUUGCCAGCGGUUCGGCCGGGCACUCUAGGGGGACUGCCGGCGACGAGCCGGAGGAAGGAGGGGAUGACGUCAGGUACUCGUGCCCCUUAUGCCCUGGGCGACACACGCGCUACAAUGGGCGGUACAAUGGGUUGCGACCCCGCGAGGGGGAGCCAAUCCCCAAAGCCGCCCUCAGUUCGGAUCGCAGGCUGCAACCCGCCUGCGUGAAGCCGGAAUCGCUAGUAAUCGCGGAUCAGCCAUGCCGCGGUGAAUACGUUCCCGGGCCUUGUACAC | ....(((((((....)))).)))..((((((((....))))))))..........((.((((..((((((.((...(((((((((....)))..((((......))))..)))))).....((((.(((((((...((..(((.....)))))....)))))))..((.(((((.....))))).)).....))))....)).).)))...))))))))..............................(((((((.....(((..((...(((....)))...))....)))....)))))))......(....(((((((........)))))))....)...............(((((((..........)))))))......................... | 16S_rRNA |
16S_rRNA-T.maritima_domain4 | ACCGCCCGUCACGCCACCCGAGUCGGGGGCUCCCGAAGACACCUACCCCAACCCGAAAGGGAGGGGGGGUGUCGAGGGAGAACCUGGCGAGGGGGGCGAAGUCGUAACAAGGUAGCCGUACCGGAAGGUGCGGCUGGAUCACCUCCUUUCU | .(.(..((...((((.(((..((((((..((((....(((((((.((((..(((....))).)))))))))))...))))..))))))..))).))))....))...)..).((((((((((....))))))))))............... | 16S_rRNA |
16S_rRNA-Z.mays_domain1 | CUCAUGGAGAGUUCGAUCCUGGCUCAGGAUGAACGCUGGCGGCAUGCUUAACACAUGCAAGUCGAACGGGAAGUGGUGUUUCCAGUGGCGAACGGGUGAGUAACGCGUAAGAACCUGCCCUUGGGAGGGGAACAACAACUGGAAACGGUUGCUAAUACCCCGUAGGCUGAGGAGCAAAAGGAGAAAUCCGCCCAAGGAGGGGCUCGCGUCUGAUUAGCUAGUUGGUGAGGCAAUAGCUUACCAAGGCGAUGAUCAGUAGCUGGUCCGAGAGGAUGAUCAGCCACACUGGGACUGAGACACGGCCCAGACUCCUACGGGAGGCAGCAGUGGGGAAUUUUCCGCAAUGGGCGAAAGCCUGACGGAGCAAUGCCGCGUGGAGGUGGAAGGCCUACGGGUCGUCAACUUCUUUUCUCGGAGAAGAAACAAUGACGGUAUCUGAGGAAUAAGCAUCGGCUAACUCUGUGCCAGCAGCCGCGGUAAGACAGAGGAUGCAAGCGUUAUCCGGA | ........(((((.......))))).((((.((((((.(((((((((....(((.(((..(((..((.(((((.....))))).)))))......(((......((((.((..((...(((((((.((((.....((((((....))))))......))))....(((....)))....(((....))).)))))))..)).)).))))(((....(((..((((((((.......)))))))))))......)))..((((((((....))))...))))))).(((((............))))).((((....))))...)))))).).....(.(((...(((((....))))).)))).)).))))))..((((......((((....)))).....)))).(..((((((...(.........)....))))))..)...((((((((...(((((.....((.))))).......)))))))))).))))))))))... | 16S_rRNA |
16S_rRNA-Z.mays_domain2 | AUGAUUGGGCGUAAAGCGUCUGUAGGUGGCUUUUCAAGUCCGCCGUCAAAUCCCAGGGCUCAACCCUGGACAGGCGGUGGAAACUACCAAGCUGGAGUACGGUAGGGGCAGAGGGAAUUUCCGGUGGAGCGGUGAAAUGCAUUGAGAUCGGAAAGAACACCAACGGCGAAAGCACUCUGCUGGGCCGACACUGACACUGAGAGACGAAAGCUAGGGGAGCAAAUGGGAUUAGAGACCCCAGUAGUCCUAGCCGUAAACGAUGGAUACUAGGUGCUGUGCGACUCGACCCGUGCAGUGCUGUAGCUAACGCGUUAAGUAUCCCGCCUGGGGAGUACGUUCGCAAGAAUGAAACUCA | .......(((((.....((((.(.(((.((((....(((((((((((.....((((((.....))))))...)))))))))..))...))))...(((.((((...((((((((...((((((((...(((......)))......))))))))...).......((....)).)))))))..))))..)))...))))..))))....((((((...((...((((.........))))...))))))))..........((((((..(((((((((((........)))))))))))...((..)))).....)))))).))).(((......((((....))))....))). | 16S_rRNA |
16S_rRNA-Z.mays_domain3 | AAGGAAUUGACGGGGGCCCGCACAAGCGGUGGAGCAUGUGGUUUAAUUCGAUGCAAGGCGAAGAACCUUACCAGGGCUUGACAUGCCGCGAAUCCUCUUGAAAGAGAGGGGUGCCCUCGGGAACGCGGACACAGGUGGUGCAUGGCUGUCGUCAGCUCGUGCCGUAAGGUGUUGGGUUAAGUCUCGCAACGAGCGCAACCCUCGUGUUUAGUUGCCACUAUGAGUUUGGAACCCUGAACAGACCGCCGGUGUUAAGCCGGAGGAAGGAGAGGAUGAGGCCAAGUCAUCAUGCCCCUUAUGCCCUGGGCGACACACGUGCUACAAUGGGCGGGACAAAGGGUCGCGAUCUCGCGAGGGUGAGCUAACUCCAAAAACCCGUCCUCAGUUCGGAUUGCAGGCUGCAACUCGCCUGCAUGAAGCAGGAAUCGCUAGUAAUCGCCGGUCAGCCAUACGGCGGCGAAUCCGUUCCCGGGCCUUGUACAC | .......(((((.(((((((.((..((((((.((((((((((....((((........))))........(((((((......(((((((..(((((((....))))))).(.((....)).)))))).))..((.((((..((((((.(....(((((((((....)))..((((......))))..)))))).....((((.(((((((...(((.........)))....)))))))..((.(((((.....))))).)).....)))).....).).)))...))))))))....)))))))...)).)))))))).)...(((((((.....(((..((...(((....)))...))....))).....)))))))......(....(((((((........)))))))....).....)))))......((((((..........)))))).......))...)))))))))).)). | 16S_rRNA |
16S_rRNA-Z.mays_domain4 | ACCGCCCGUCACACUAUAGGAGCUGGCCAGGUUUGAAGUCAUUACCCUUAACCGUAAGGAGGGGGAUGCCUAAGGCUAGGCUUGCGACUGGAGUGAAGUCGUAACAAGGUAGCCGUACUGGAAGGUGCGGCUGGAUCACCUCCUUU | ...(..((...((((.(((..((.((((.((((....(.((((.((((...((....)).)))))))).)...)))).)))).))..))).))))....))...)....((((((((((....))))))))))............. | 16S_rRNA |
23S_rRNA-B.subtilis_domain3 | AGAGGGGUGAGAAUCCCUCCACCGAAUGCCUAAGGGUUCCUGAGGAAGGCUCGUCCGCUCAGGGUUAGUCGGGACCUAAGCCGAGGCCGAAAGGCGUAGGCGAUGGACAACAGGUUGAUAUUCCUGUACCACCUCCUCACCAUUUGAGCAAUGGGGGGUCGCAGGAGGAUAGGGUAAGCGCGGUAUUGGAUAUCCGCGUCCAAGCAGUUAGGCUGGGAAAUAGGCAAAUCCGUUUCCCAUAAGGCUGAGCUGUGAUGGCGAGCGAAAUAUAGUAGCGAAGUUCCUGAUUCCACACUGCCAAGAAAAGCCUCUAGCGAGGUGAGAGGUGCCCGUACCGCAAACCGUCACAGGUAGGCGAGGAGAGAAUCCUAAGGUGA | .((((((......))))))((((....((((..((...((((((...((.....)).))))))....((((((.((...(((.(.(((....))).).)))...))...(((((........)))))))(((((.((((((......((...((((....((((..(((..(((.((((((((..........))))))((..((((...(((((((((((.((.....)))))))))....))))...))))...))...((.(.......).))....)))))...)))...)))).........))))..))..)))))))))))))))..)).....((......)).)))).((((.....))))..)))). | 23S_rRNA |
23S_rRNA-B.subtilis_domain4 | UCGAGAGAACUCUCGUUAAGGAACUCGGCAAAAUGACCCCGUAACUUCGGGAGAAGGGGUGCUCUGUUAGGGUGCAAGCCCGAGAGAGCCGCAGUGAAUAGGCCCAGGCGACUGUUUAGCAAAAACACAGGUCUCUGCGAAGCCGUAAGGCGAAGUAUAGGGGCUGACGCCUGCCCGGUGCUGGAAGGUUAAGAGGAGCGCUUAGCGUAAGCGAAGGUGCGAAUUGAAGCCCCAGUAAACGGCGGCCGUAACUAUAACGGUCCUAAGGUAGCGAAAUUCCUUGUCGGGUAAGUUCCGACCCGCACGAAAGGCGCAACGAUCUGGGCGCUGUCUCAACGAGAGACUCGG | .((((....((((((((.(((..............(((((....(....).....)))))(((((.((.((((....)))))).)))))(...).......(((((((((..(((.........)))..(((((((((...(((....)))...)..))))))))..((((.(((..(((((((..(((...((...(((((..((....))...)))))...))...))))))))..)))))((((((.......))))))(...).....(.........((((((.....))))))).........))))...)).)))))))....))).)))))))).)))). | 23S_rRNA |
23S_rRNA-B.subtilis_domain6 | UGGAAAUUUGAGAGGAGCUGUCCUUAGUACGAGAGGACCGGGAUGGACGCACCGCUGGUGUACCAGUUGUUCUGCCAAGGGCAUCGCUGGGUAGCUAUGUGCGGACGGGAUAAGUGCUGAAAGCAUCUAAGCAUGAAGCCCCCCUCAAGAUGAGAUUUCCCAUUCCGCAAGGAAGUAAGAUCCCUGAAAGAUGAUCAGGUUGAUAGGUCUGAGGUGGAAGUGUGGCAACACAUGGAGCUGACAGAUACUAAUCGAUCG | .((((((((..((((..(((((((...............))))))).(((((...(((....(((((((((((....))))))..)))))....))).)))))...(((....(((((...........)))))....))).))))......))))))))..((((....))))....(((((((((.......)))))....((((((((.((.....(((((....)))))....))..))))).)))...)))). | 23S_rRNA |
23S_rRNA-E.coli_domain3 | AAGCGGGUGAAAAGCCCGCUCGCCGGAAGACCAAGGGUUCCUGUCCAACGUUAAUCGGGGCAGGGUGAGUCGACCCCUAAGGCGAGGCCGAAAGGCGUAGUCGAUGGGAAACAGGUUAAUAUUCCUGUACUUGGUGUUACUGCGAAGGGGGGACGGAGAAGGCUAUGUUGGCCGGGCGACGGUUGUCCCGGUUUAAGCGUGUAGGCUGGUUUUCCAGGCAAAUCCGGAAAAUCAAGGCUGAGGCGUGAUGACGAGGCACUACGGUGCUGAAGCAACAAAUGCCCUGCUUCCAGGAAAAGCCUCUAAGCAUCAGGUAACAUCAAAUCGUACCCCAAACCGACACAGGUGGUCAGGUAGAGAAUACCAAGGCGC | .((((((.......))))))((((....((((..((...((((((...((.....)).))))))....(((((..((...(((.(.(((....))).).)))...))...(((((........)))))))(((((((((((((..(((((....((((..(((..(((((((((((..........))))))((..((((...((((((((((((.((.....))))))))))..))))...))))...))...(((((....)))))....)))))...)))...)))).........)))))..))....))))))))))).)))..)).....((......)).)))).((((.....))))..)))). | 23S_rRNA |
23S_rRNA-E.coli_domain4 | UUGAGAGAACUCGGGUGAAGGAACUAGGCAAAAUGGUGCCGUAACUUCGGGAGAAGGCACGCUGAUAUGUAGGUGAGGUCCCUCGCGGAUGGAGCUGAAAUCAGUCGAAGAUACCAGCUGGCUGCAACUGUUUAUUAAAAACACAGCACUGUGCAAACACGAAAGUGGACGUAUACGGUGUGACGCCUGCCCGGUGCCGGAAGGUUAAUUGAUGGGGUUAGCGCAAGCGAAGCUCUUGAUCGAAGCCCCGGUAAACGGCGGCCGUAACUAUAACGGUCCUAAGGUAGCGAAAUUCCUUGUCGGGUAAGUUCCGACCUGCACGAAUGGCGUAAUGAUGGCCAGGCUGUCUCCACCCGAGACUCAG | .((((....((((((((.(((..............(((((....(....).....)))))((((((...(((.....((((.....))))....)))..))))))(...).......(((((((((..(((.........)))..(((((((((...(((....)))...)..))))))))..((((.(((..(((((((..(((........(((((..((....))...)))))........))))))))..)))))((((((.......))))))(...).....(.........((((((.....))))))).........))))...)).)))))))....))).)))))))).)))). | 23S_rRNA |
23S_rRNA-E.coli_domain6 | UGGAGAACUGAGGGGGGCUGCUCCUAGUACGAGAGGACCGGAGUGGACGCAUCACUGGUGUUCGGGUUGUCAUGCCAAUGGCACUGCCCGGUAGCUAAAUGCGGAAGAGAUAAGUGCUGAAAGCAUCUAAGCACGAAACUUGCCCCGAGAUGAGUUCUCCCUGACCCUUUAAGGGUCCUGAAGGAACGUUGAAGACGACGACGUUGAUAGGCCGGGUGUGUAAGCGCAGCGAUGCGUUGAGCUAACCGGUACUAAUGAACCG | .((((((((..((((..(((((((...............))))))).(((((...(((....(((((((((((....))))))..)))))....))).)))))...(((....(((((...........)))))....))).))))......))))))))..((((((...)))))).....((..(((((.......)))))....((((((((..(.....(((((....)))))....)...))))).))).....)). | 23S_rRNA |
23S_rRNA-H.pylori_domain3 | AGAUAUAUGAGAAUUGUAUCCGCCGUAAAUCUAAGGUUUCCUACGCGAUGGUCGUCAUCGUAGGGUUAGUCGGGUCCUAAGCCGAGUCCGAAAGGGGUAGGUGAUGGCAAAUUGGUUAAUAUUCCAAUACCGACUGUGGAGCGUGAUGGGGGGACGCAUAGGGUUAAGCGAGCUAGCUGAUGGAAGCGCUAGUCUAAGGGCGUAGAUUGGAGGGAAGGCAAAUCCACCUCUGUAUUUGAAACCCAAACAGGCUCUUUGAGUCCUUUUAGGACAAAGGGAGAAUCGCUGAUACCGUCGUGCCAAGAAAAGCCUCUAAGCAUAUCCAUAGUCGUCCGUACCGCAAACCGACACAGGUAGAUGAGAUGAGUAUUCUAAGGCGC | .((((((.......))))))((((....((((..((...((((((...((.....)).))))))......((((.((...(((.(.(((....))).).)))...))...(((((........)))))..((((((((((..((...((((....((((..(((..(((((((((((..........))))))((..(((....(((....(((..((.....)).)))....))).....)))....)).((((((..(((((...)))))..))))))..)))))...)))...)))).........))))...))...))))))))))))))..)).....((......)).)))).(((.......)))..)))). | 23S_rRNA |
23S_rRNA-H.pylori_domain4 | GUGAAAGAACUCUGGUUAAGGAACUCUGCAAACUAGCACCGUAAGUUCGCGAUAAGGUGUGCCACAGCGAUGUGGUCUCAGCAAAGAGUCCCUCCCGACUGUUUACCAAAAACACAGCACUUUGCCAACUCGUAAGAGGAAGUAUAAGGUGUGACGCCUGCCCGGUGCUCGAAGGUUAAGAGGAUGCGUCAGUCGCAAGAUGAAGCGUUGAAUUGAAGCCCGAGUAAACGGCGGCCGUAACUAUAACGGUCCUAAGGUAGCGAAAUUCCUUGUCGGUUAAAUACCGACCUGCAUGAAUGGCGUAACGAGAUGGGAGCUGUCUCAACCAGAGAUUCAG | .((((....((((((((.(((..............(((((....(....).....)))))((((((....))))))(...).......((((..(((..(((.........)))..(((((((((...(((....)))...)..))))))))..((((.(((..(((((((..((((..((....((((..(((....)))...))))....))..)))))))))..)))))((((((.......))))))(...)...............((((((.....))))))..........))))...)).)..))))....))).)))))))).)))). | 23S_rRNA |
23S_rRNA-H.pylori_domain6 | AGGAAAGUUGAGGAGAGCUGUCCCUAGUACGAGAGGACCGGGAUGGACGUGUCACUGGUGCACCAGUUGUCUGCCAAGAGCAUCGCUGGGUAGCACACACGGAUGUGAUAACUGCUGAAAGCAUCUAAGCAGGAACCAACUCCAAGAUAAACUUUCCCUGAAGCUCGCACAAAGACUAUGUGCUUGAUAGGGUAGAUGUGUGAGCGCAGUAAUGCGUUUAGCUGACUACUACUAAUAGAGCG | .((((((((..((((..(((((((...(.(....).)..))))))).(((((...(.(....((((((((((....))).))..)))))....)).)))))....((....(((((...........)))))....)).))))......)))))))).....(((((((((.......)))))....((((((((..(.....(((((....)))))....)...))))).)))...)))). | 23S_rRNA |
23S_rRNA-S.aureus_domain3 | AGACGGGUGAGAAUCCCGUCCACCGAUUGACUAAGGUUUCCAGAGGAAGGCUCGUCCGCUCUGGGUUAGUCGGGUCCUAAGCUGAGGCCGACAGGCGUAGGCGAUGGAUAACAGGUUGAUAUUCCUGUACCACCUAUAAUCGUUUUAAUCGAUGGGGGGACGCAGUAGGAUAGGCGAAGCGUGCGAUUGGAUUGCACGUCUAAGCAGUAAGGCUGAGUAUUAGGCAAAUCCGGUACUCGUUAAGGCUGAGCUGUGAUGGGGAGAAGACAUUGUGUCUUCGAGUCGUUGAUUUCACACUGCCGAGAAAAGCCUCUAGAUAGAAAAUAGGUGCCCGUACCGCAAACCGACACAGGUAGUCAAGAUGAGAAUUCUAAGGUGA | .((((((.......))))))((((....((((..((...((((((...((.....)).))))))....((((((.((...(((.(.(((....))).).)))...))...(((((........)))))))(((((((..((.......((...((((....((((..(((..(((((.((((((.........))))))((..((((...(((((((((((.((.....))))))))).....))))...))))...))...(((((((...)))))))...)))))...)))...)))).........))))..))..))..)))))))))))..)).....((......)).)))).(((.......)))..)))). | 23S_rRNA |
23S_rRNA-S.aureus_domain4 | GCGAGCGAACUCUCGUUAAGGAACUCGGCAAAAUGACCCCGUAACUUCGGGAGAAGGGGUGCUCUUUAGGGUUAACGCCCAGAAGAGCCGCAGUGAAUAGGCCCAAGCGACUGUUUAUCAAAAACACAGGUCUCUGCUAAACCGUAAGGUGAUGUAUAGGGGCUGACGCCUGCCCGGUGCUGGAAGGUUAAGAGGAGUGGUUAGCUUCUGCGAAGCUACGAAUCGAAGCCCCAGUAAACGGCGGCCGUAACUAUAACGGUCCUAAGGUAGCGAAAUUCCUUGUCGGGUAAGUUCCGACCCGCACGAAAGGCGUAACGAUUUGGGCACUGUCUCAACGAGAGACUCGG | .((((....((((((((.(((..............(((((....(....).....)))))(((((((.((((....)))).)))))))(...).......(((((((((..(((.........)))..(((((((((...(((....)))...)..))))))))..((((.(((..(((((((..(((...((...(((((..((....))...)))))...))...))))))))..)))))((((((.......))))))(...)...............((((((.....))))))..........))))...)).)))))))....))).)))))))).)))). | 23S_rRNA |
23S_rRNA-S.aureus_domain6 | AGGAAAUUUGAGAGGAGCUGUCCUUAGUACGAGAGGACCGGGAUGGACAUACCUCUGGUGUACCAGUUGUCGUGCCAACGGCAUAGCUGGGUAGCUAUGUGUGGACGGGAUAAGUGCUGAAAGCAUCUAAGCAUGAAGCCCCCCUCAAGAUGAGAUUUCCCAACUUCGGUUAUAAGAUCCCUCAAAGAUGAUGAGGUUAAUAGGUUCGAGGUGGAAGCAUGGUGACAUGUGGAGCUGACGAAUACUAAUCGAUCG | .((((((((..((((..(((((((...............))))))).(((((...(((....(((((((((((....))))))..)))))....))).)))))...(((....(((((...........)))))....))).))))......)))))))).(((....)))....(((((((((.......)))))....((((((((.((.....(((((....)))))....))..))))).)))...)))). | 23S_rRNA |
23S_rRNA-T.thermophilus_domain3 | AAGAGGGUGAGAAUCCCUCUCGCCGUAAGCCCAAGGGUUCCUACGCAAUGGUCGUCAGCGUAGGGUUAGGCGGGACCUAAGGUGAAGCCGAAAGGCGUAGCCGAAGGGCAGCCGGUUAAUAUUCCGGCCCUUCCCGCAGGUGCGAUGGGGGGACGCUCUAGGCUAGGGGGACCGGAGCCAUGGACGAGCCCGGCCAGAAGCGCAGGGUGGGAGGUAGGCAAAUCCGCCUCCCAACAAGCUCUGCGUGGUGGGGAAGCCCGUACGGGUGACAACCCCCCGAAGCCAGGGAGCCAAGAAAAGCCUCUAAGCACAACCUGCGGGAACCCGUACCGCAAACCGACACAGGUGGGCGGGUGCAAGAGCACUCAGGCGC | .((((((......).)))))((((....((((..((...((((((...((.....)).))))))......((((.((...(((.(.(((....))).).)))...))...(((((........)))))..(((((((((((((...((((....((((..(((..(((((.((((..............))))......((((((((((((((((.((.....)))))))))).....)))))))).........((((....))))......)))))...)))...)))).........))))...))...)))))))))))))))..)).....((......)).)))).((((......))))..)))). | 23S_rRNA |
23S_rRNA-T.thermophilus_domain4 | GCGGGAGAACCCUCGCCAAGGAACUCUGCAAGUUGGCCCCGUAACUUCGGGAGAAGGGGUGCUCCCUGGGGUGAUGAGCCCCGGGGAGCCGCAGUGAACAGGCUCUGGCGACUGUUUACCAAAAACACAGCUCUCUGCGAACUCGUAAGAGGAGGUAUAGGGAGCGACGCUUGCCCGGUGCCGGAAGGUCAAGGGGAGGGGUGCAAGCCCCGAACCGAAGCCCCGGUGAACGGCGGCCGUAACUAUAACGGUCCUAAGGUAGCGAAAUUCCUUGUCGGGUAAGUUCCGACCUGCACGAAAAGCGUAACGACCGGAGCGCUGUCUCGGCGAGGGACCCGG | .((((....((((((((.(((..............(((((....(....).....)))))((((((((((((.....))))))))))))(...).......(((((((((..(((.........)))..(((((((((...(((....)))...)..))))))))..((((.(((..(((((((..(((...((...(((((....)))))...))...))))))))..)))))((((((.......))))))(...)...............((((((.....))))))..........))))...)).)))))))....))).)))))))).)))). | 23S_rRNA |
23S_rRNA-T.thermophilus_domain6 | AGGAGGCUUGAGGGGGGCUCUUCCUAGUACGAGAGGACCGGAAGGGACGCACCUCUGGUUUCCCAGCUGUCCCUCCAGGGGCAUAAGCUGGGUAGCCAUGUGCGGAAGGGAUAACCGCUGAAAGCAUCUAAGCGGGAAGCCCGCCCCAAGAUGAGGCCUCCCACGGCGUCAAGCCGGUAAGGACCCGGGAAGACCACCCGGUGGAUGGGCCGGGGGUGUAAGCGCCGCGAGGCGUUGAGCCGACCGGUCCCAAUCGUCCG | .((((((((..((((..(((((((...............))))))).(((((...(((....(((((((((((....))))))...)))))....))).)))))...(((....(((((...........)))))....))).))))......))))))))..((((.....))))....(((((((((.......)))))....((((((((.((.....(((((....)))))....))..))))).)))...)))). | 23S_rRNA |
5S_rRNA-Acanthamoeba-castellanii-1 | GGAUACGGCCAUACUGCGCAGAAAGCACCGCUUCCCAUCCGAACAGCGAAGUUAAGCUGCGCCAGGCGGUGUUAGUACUGGGGUGGGCGACCACCCGGGAAUCCACCGUGCCGUAUCCU | (((((((((....((((((((.....((((((............))))..))....)))))).)).(((((......(((((.(((....)))))))).....))))).))))))))). | 5S_rRNA |
5S_rRNA-Acanthamoeba-castellanii-2 | GGAUACGGCCAUACUGCGCAGAAAGCACCGCUUCCCAUCCGAACAGCGAAGUUAAGCUGCGCGAGGCGGUGUUAGUACUGGGGUGGGCGACCACCCGGGAAUCCACCGUGCCGUAUCCU | (((((((((....((((((((.....((((((............))))..))....)))))).)).(((((......(((((.(((....)))))))).....))))).))))))))). | 5S_rRNA |
5S_rRNA-Acetobacter-aceti-2 | GGACCUGGUGGCUAUGGCGGGAGAGAUCCACCCGAUCCCAUCCCGAACUCGGCCGUGAAAACCCCCAGCGCCUAUGAUACUGCGGCUUAAGCCGUGGGAAAGUCGGUCGCCGCCAGGUCC | .((((((((((.....(((((.(......((((((.............))))..)).....).))).)).((.((....(((((((....)))))))....)).))...)))))))))). | 5S_rRNA |
5S_rRNA-Acetobacter-sp.-1 | GAUCUGGUGGCCAUGGCGGGGCGCAAUCACCCGAUCCCAUCCCGAACUCGGCCGUCAAAUGCCCCAGCGCCCAUGAUACUCUGCCUCAAGGCACGGAAAAGUCGGUCGCCGCCAGAUCC | ((((((((((.....((((((((.....((((((.............))))..))....)))))).)).((.((....((.((((....)))).))....)).))...)))))))))). | 5S_rRNA |
5S_rRNA-Acheta-domesticus-1 | GCCAACGUCCAUACCACGUUGAAAGCACCGGUUCUCGUCCGAUCACCGAAGUUAAGCAGCGUCGGGCGCGGUUAGUACUUGGAUGGGUGACCGCCUGGGAACCCCGCGUGACGUUGGCAU | (((((((((....((((((((.....((((((............))))..))....)))))).)).(((((......((.((.(((....))))).)).....))))).))))))))).. | 5S_rRNA |
5S_rRNA-Acholeplasma-laidlawii-1 | UCUGGUGACGAUAGGUAAGAUGGUUCACCUGUUCCCAUCCCGAACACAGAAGUUAAGCAUCUUAGCGCCGACGAUAGUUAUUACAAUUAGCGAAAAUAGGACGUUGCCAGGC | ((((((((......((((((((....((((((.............))))..))....)))))).)).((.(.....((((.(...).)))).....).))...)))))))). | 5S_rRNA |
5S_rRNA-Acholeplasma-laidlawii-2 | UCUGGUGACGAUGGCAAGAUGUUCCACCUGUUCCCUACCCGAAUAUAGAAGUUAAGCAUCUUAGCGCCGACGAUAGUUAUUACAAUUAGCGAAAAUAGGACGUUGCCAGGC | ((((((((.....((((((((....((((((.............))))..))....)))))).)).((.(.....((((.(...).)))).....).))...)))))))). | 5S_rRNA |
5S_rRNA-Acholeplasma-laidlawii-3 | UCUGGUGACGAUGGCAAGAUGGUUCCACCUGUUCCCAUCCCGAACACAGAAGUUAAGCAUCUUAGCGCCGACGAUAGUUAUUACAAUUAGCGAAAAUAGGACGUUGCCAGGC | ((((((((.....((((((((.....((((((.............))))..))....)))))).)).((.(.....((((.(...).)))).....).))...)))))))). | 5S_rRNA |
5S_rRNA-Achromobacter-cycloclastes-1 | CGACCUGGUGGUUCUGGCGGGGUGGCUGCACCCGUUCCCAUUCCGAACACGGCCGUGAAACGCCCCAGCGCCGAUGGUACUUCGUCUUAAGACGCGGGAGAGUAGGUCGCUGCCAGGUCU | .((((((((((.....((((((((.....((((((.............))))..))....)))))).)).((.((....((.((((....)))).))....)).))...)))))))))). | 5S_rRNA |
5S_rRNA-Achromobacter-denitrificans-1 | UGCCUGACGACCAUAGCGAGUUGGUCCCACUCCUUCCCAUCCCGAACAGGACAGUGAAACGACUUUGCGCCGAUGAUAGUGGACGGACGUCUGUGAAAGUAGGUCAUCGUCAGGC | .(((((((((.....((((((((.....((((((.............))))..))....)))))).)).((.((....((((((....))))))....)).))...))))))))) | 5S_rRNA |
5S_rRNA-Achromobacter-xylosoxidans-1 | CCUGACGACCAUAGCAAGGUGGUACCACUCCUUCCCAUCCCGAACAGGACAGUGAAACGCCUUUGCGCCGAUGAUAGUGGACGGACGUCUGUGAAAGUAGGUCAUCGUCAGGCU | ((((((((.....((((((((.....((((((.............))))..))....)))))).)).((.((....((((((....))))))....)).))...)))))))).. | 5S_rRNA |
5S_rRNA-Acidiphilium-acidophilum-1 | CGACCUGGUGGCCAUUGCGGGGGGCCCGCACCCGAUCCCAUCCCGAACUCGGCCGUGAAAACCCCCAGCGCCCAUGGUACUGUGCCUCAAGGCACGGGAGAGUAGGUCGCCGCCAGGUCC | .((((((((((.....(((((((......((((((.............))))..)).....))))).)).((.((....(((((((....)))))))....)).))...)))))))))). | 5S_rRNA |
5S_rRNA-Acidiphilium-cryptum-1 | CGACCUGGUGGCCAUUGCGGGGAGCCUGCACCCGAUCCCAUCCCGAACUCGGCCGUGAAAAUCCCCAGCGCCCAUGGUACUGUGCCUCAAGGCACGGGAGAGUAGGUCGCCGCCAGGUCCUC | .((((((((((.....(((((((......((((((.............))))..)).....))))).)).((.((....(((((((....)))))))....)).))...))))))))))... | 5S_rRNA |
5S_rRNA-Acidithiobacillus-ferrooxidans-1 | UGUCUGGCGGCCAUAGCGCAGUGGAACCACCCCUUCCCAUCUCGAACAGGACCGUGAAACGCUGCAGCGCCUAUGAUAGUUGAGGGUCUCCCUCCGCGAAAGUCGGUCACCGCCAGAC | .(((((((((.....((((((((.....((.(((.............)))...))....)))))).)).((.((....((.(((((...))))).))....)).))...))))))))) | 5S_rRNA |
5S_rRNA-Acidithiobacillus-ferrooxidans-2 | UGCCUGGUGGCCAUAGCGAGCGGGAACCACCCGAUCCCAUUCCGAACUCGGAAGUGAAAACGCUUAGCGCCGAUGAUAGUAUGGGGUCUCCCUAUGCGAAAGUAGGACACUGCCAGGCUU | .(((((((((.....(((((((......((((((.............))))..)).....))))).)).((.((....((((((((...))))))))....)).))...))))))))).. | 5S_rRNA |
5S_rRNA-Acidithiobacillus-ferrooxidans-3 | UGUCUGGCGGCCAUAGCGCAGUGGAACCACCCCUUCCCAUCUCGAACAGGACCGUGAAACGCUGCAGCGCCUAUGAUAGUUGAGGGUCUCCCUCCGCGAAAGUCGGUCACCGCCAGACAC | ((((((((((.....((((((((.....((.(((.............)))...))....)))))).)).((.((....((.(((((...))))).))....)).))...)))))))))). | 5S_rRNA |
5S_rRNA-Acidithiobacillus-thiooxidans-1 | UUGUCUGGCGGCCAUAGCGCAGUGGAACCACCCCUUCCCAUCCCGAACAGGACCGUGAAACACUGCAGCGCCUAUGAUAGUUGAGGGCCUCCCUCCGCGAAAGUCGGUCACCGCCAGACAC | .((((((((((.....((((((((.....((.(((.............)))...))....)))))).)).((.((....((.(((((...))))).))....)).))...)))))))))). | 5S_rRNA |
5S_rRNA-Acidovorax-delafieldii-1 | UGCCUGAUGACCAUAGCAAGUUGGUCCCACUCCUUCCCAUCCCGAACAGGACAGUGAAACGACUUUGCGCCGAUGAUAGUGCGGGUUCCCGUGUGAAAGUAGGUCAUCGUCAGGC | .(((((((((.....((((((((.....((((((.............))))..))....)))))).)).((.((....((((((....))))))....)).))...))))))))) | 5S_rRNA |